彌生時代出現於北海道以外的全日本列島、這時開始有水稻種植出現。時間大約是西元前5世紀中到西元3世紀中頃。
這段時期的名稱源自於東京的彌生町，在這裏發現了無花紋、帶紅色的陶器。根據陶器的形式，可分為前、中、後三期。前期從九州擴展到京畿一帶（東日本尚處於繩文時代末期），中期波及到東北地方。扁平片刃石斧等磨製石器、青銅器和前期北九州的支石墓等類似於大陸文化。彌生文化從一開始就具有先進的農耕技術，通常認為它受到了來自朝鮮的移民的影響。中期以後灌溉技術進步，農業生産漸趨穩定。後期，鐵製農具普及，石器已幾乎消失。銅鐸、銅劍、銅矛、銅戈等青銅祭器發達，出現製鐵和製????等社會分工。通過交易和戰爭等，形成了統一的政治性的地區集團。此時北海道尚不能種植水稻，仍處在繩紋文化階段。
公元前後，倭人分為百餘國，來漢朝貢。
漢光武帝賜倭奴國王印綬 “漢倭奴國王”金印。
日本的由來在漢朝時期，一個來自東方海域的島國因為久慕大漢文明與繁華，便不遠萬裏涉海越山來朝漢朝，漢光武帝賜奴國“漢倭奴國王”之印，至今這塊印章仍然陳列在倭奴國的福岡市。
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倭國王帥升等獻生口於漢安帝。
184 前後
倭國大亂，邪馬臺國女王卑彌呼以“事鬼道，能惑衆”立，尊卑有差，收租稅。
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卑彌呼遣使朝魏。魏賜號親魏倭王。
最早對日本有確切記載的歷史著作是東漢史學家班固寫的《漢書》。該書《地理志·燕地》成日本列島為“倭”，當時日本列島的人接受了這一稱呼。
公元6世紀，倭國開始大力吸收中國的先進技術、文化，從而使其政治，經濟迅速發展，國力漸強。倭國國王逐對“倭”的稱號感到不滿，並自認為居於國之東，乃日出之處，便逐漸用“日”字代國名。據《隋書·倭國傳》記載：公元607前倭國派遣小野妹子使隋，國書上寫着：“日出處天子致書日沒處天子”，由過去自稱倭王改為稱“日出處天子”。
日本福岡市出土的“漢倭奴國王”金印
金印的形狀
金印是邊長23mm的純金(23金)方形印，高22mm，底座厚約9mm，重108.7g。印面以陰文刻，漢─委奴─國王三行五字。鈕是蛇盤成團狀的蛇鈕，全身以魚子文(顆粒狀凸紋)呈現鱗，蛇身刻綫，頭部刻有二眼。
古代日本海寇。日本古稱倭奴國，故中國古代史籍將這些日本海寇以及後來與之勾結的內陸姦民，通稱為倭寇。自元末至明萬歷年間，一部分日本武人、浪人（流亡海上的敗將殘兵）、海盜商人和破産農民，不斷侵擾中國、朝鮮沿海地區，前後歷時達三百年之久。
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