1988年之后，随着“气功热”的兴起，柯云路开始转向东方神秘主义主题，陆续发表多部“研究 ”气功与特异功能的著作，包括《人类神秘现象破译》、《中国气功大趋势》、《中国气功九大技术》、《生命特异现象考察》等，并自称“特异功能研究者”。后又转入“生产”医学著作，著有《新疾病学》、《发现黄帝内经》等，其《发现黄帝内经》一书竭力鼓吹胡万林，为其套上“神医”光环。在胡万林被立案审查后，柯云路为给其正名翻案，又出版“研究胡万林专著”《重组生命世界》。
柯云路，中国大陆最有争议的作家。1968年从北京到山西农村插队，1972年调入山西榆次锦纶厂。1980年开始写作，并多次获奖。现为山西作家协会专业作家。八十年代曾出版过有影响的书写时代改革的长篇小说《新星》、《夜与昼》、《衰与荣》等多部作品；九十年代出版过《情商启蒙》，《超级圈套》，《东方的故事》，《成功者》，《合欢》等教育、商战边缘学科长篇著作。2000年之后，陆续出版了对中国近当代史进行严肃思考的长篇小说《芙蓉国》、《蒙昧》、《牺牲》、《黑山堡纲鉴》、《那个夏天你干了什么》。
近期出版的《童话人格》在国内外引起轰动。2000年以来，出版了《芙蓉国》、《蒙昧》、《牺牲》、《黑山堡纲鉴》、《那个夏天你干了什么》等多部以文化大革命为背景的长篇小说。其中《新星》、《龙年档案》被拍成电视连续剧。还出版了非文学类作品《人类时间》、《情商启蒙》、《童话人格》、《心灵太极》等。
创作年表
1980年，处女作短篇小说《三千万》在《人民文学》发表，并获当年全国优秀短篇小说一等奖。
1984年，《当代》刊登第一部长篇小说《新星》，人民文学出版社出书。
同年，中央人民广播电台在“小说连播”节目中播出，山西人民广播电台将其改编为广播剧。
1986年，根据这部作品改编的同名电视连续剧于春节期间在中央电视台播出，引起极大轰动，曾创电视连续剧收视率最高纪录。
《新星》获人民文学奖。
1985年，《花城》刊登长篇小说(节选)《汾城轶闻——一个系统工程学家的遭遇》，1986年，人民文学出版社出版《汾城轶闻》。
1985年，《黄河》刊登长篇小说《孤岛》，同年北岳文艺出版社出版。
1986年，《当代》刊登《新星》续集长篇小说《夜与昼》，同年人民文学出版社出版。
《夜与昼》获人民文学奖。
1986年，花城出版社出版中篇小说集《黎明与黄昏》。
1987年，《当代》刊登《夜与昼》续集长篇小说《衰与荣》。1988年人民文学出版社出版。
1989年，《小说家》刊登长篇小说《嫉妒之研究》。1990年百花文艺出版社出版。
1989年，《当代》刊登长篇小说《大气功师》，同年人民文学出版社出版。
1990年，《十月》刊登长篇小说《新世纪》(上部)，1991年内蒙古人民出版社出版。
1991年， 花城出版社出版《人类神秘现象破译》。
1991年，《当代》刊登中篇小说《陌生的小城》。
1991年，作家出版社出版系列小说《十年梦魇(中国1966—1976)》。
1991年，上海人民出版社出版随笔《人是宇宙的精灵》。
1994年，上海人民出版社出版随笔《显现的灵光》。
1996年，上海人民出版社出版随笔《复归于婴儿》。
1994年，今日中国出版社出版《生命特异现象考察》。
1997年，新华出版社出版《情商启蒙》。
1997年，新世界出版社出版《中国孩子成功法》。
1997年，新华出版社出版长篇小说《超级圈套》。
1997年，《当代》刊登长篇小说《东方的故事》，人民文学出版社出版。
《东方的故事》被新华书店总店评为该年度虚构类作品销售书排行榜第一名。
1998年，中国文学出版社出版长篇小说《成功者》。
1998年，新世界出版社出版《新疾病学》。
1998年，改革出版社出版《人类时间》。
1998年，作家出版社出版《发现黄帝内经》。
2000年，电影出版社出版长篇小说《芙蓉国》，作者化名“辛克”。
2000 年，《花城》刊登长篇小说《蒙昧》，同年花城出版社出版。
2000 年，《大家》刊登长篇小说《牺牲》，同年云南出版社出版。
2000年，《花城》刊登长篇小说《黑山堡纲鉴》，同年花城出版社出版。
2001年，《收获》刊登长篇小说《那个夏天你干了什么》(原名《青春狂》)，2002年工人出版社出版。
2001年，新华出版社出版《中学生成功法》。
2002年，南海出版公司出版《家教现场——今天我们怎样做父母》。
2002年，春风文艺出版社出版长篇小说《合欢》。
2002年，《当代》刊登长篇小说《龙年档案》，人民文学出版社同年出版。
根据同名小说改编的电视连续剧已由西安电影制片厂拍摄完成，正在全国各省台陆续播出。
2002年，柯云路因其创作的《龙年档案》，被权威文学研究机构及多家新闻媒体评为本年度“最会变脸的作家”。
2003年，新华出版社出版《把孩子培养成学习的天才》。
2003年，新华出版社出版“柯云路作品集”《新星》、《夜与昼》、《衰与荣》、《龙年档案》。
2003年，新华出版社出版《龙年档案(电视剧版)》。
2004年，作家出版社出版《童话人格》。
2004年，长江文艺出版社出版《温情马俊仁》 。
先是建造《新星》，再是建造《大气功师》，再是建造“怀疑一切”的宣言，再是建造“宇宙的旨意 ”，再是建造5000余万元的经济实体，再是建造统率百余新老大气功师的“生命科学探索”组织，再是大气功师所控制的无以数计的气功狂恋者，绝症患者，生存失意者，轻度精神病人，自虐者，信仰真空者——一个庞大有序的社会网络已然成形，柯云路傲然耸立于塔座的顶尖，他的下面是大气功师们，大气功师们下面是这些崇拜者、迷狂者、拥戴者，柯云路新家族终于诞生了，柯云路帝国终于成立了，东方宗教以接近成熟。现代教祖，这个曾令理性感到震惊的字眼，却在中国复活了。
复活之后的中国，终南山，便是缩影。