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| tuō mǎ sī · jié fěi xùn | |||||||
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身为政治学家，杰斐逊秉持古典自由主义与共和主义（republicanism），制定了维吉尼亚宗教自由法（Virginia Statute for Religious Freedom, 1779, 1786）。该法日后成为美国宪法第一修正案创设条文之基础，杰斐逊式民主（Jeffersonian democracy）因他而得名。他创立并领导民主共和党（Democratic-Republican Party），成为今日民主党之前身，统治美国政治达四分之一世纪。杰斐逊曾为第二任维吉尼亚州州长（1779年─1781年）、第一任美国国务卿（1789年─1793年）、与第二任美国副总统（1797年─1801年）。
除了政治事业外，杰斐逊同时也是农业学、园艺学、建筑学、词源学、考古学、数学、密码学、测量学、与古生物学等学科的专家；又身兼作家、律师、与小提琴手；也是维吉尼亚大学之创办者。许多人认为他是历任美国总统中，智慧最高者。在1962年一个宴请49位诺贝尔奖得主的晚宴上，约翰·肯尼迪对满堂社会菁英致词说：“我觉得今晚的白宫聚集了最多的天份和人类知识——或许撇开当年杰斐逊独自在这里吃饭的时候不计。”
早年生涯与教育
依其出世当时所采行的儒略历，杰斐逊生于1743年4月2日；但若依其在世时改用的格雷高里历，则杰斐逊的生日为4月13日。
杰斐逊出生于富足兴旺之家，在十名手足间排行第三（有两名死产）。父亲名彼得·杰斐逊，为农民兼测量员，在维吉尼亚的阿尔伯马尔郡（Albemarle County）拥有一座名为沙德维尔（Shadwell）的农场；母亲珍·蓝道夫（Jane Randolph），为伊沙汉·蓝道夫（Isham Randolph）与珍·罗杰斯（Jane Rogers）之女，培顿·蓝道夫（Peter Jefferson）之表亲。伊沙汉是在英国伦敦城东的沙德维尔教区教堂（Shadwell Parish church）结的婚。托马斯·杰斐逊的双亲皆为世居维吉尼亚的移民家庭。
彼得·杰斐逊在宅第为大火所毁后，举家迁至业吉岭（Edge Hill）。该岭以17世纪时，帮助约翰·李伯内（John Lilburne）发展政治事业的英国内战第一场战役而得名。杰斐逊之妹露西（Lucy）嫁予查尔斯·李伯内·路易斯（Charles Lilburne Lewis），并将一个儿子命名为李伯内；而弟弟蓝道夫也将一个儿子命名为李伯内。
1752年，杰斐逊受教于苏格兰教士威廉·道格拉斯（William Douglas）所经营的学校，年仅九岁时即开始学习古拉丁文、古希腊文、以及法文。1757年，十四岁的杰斐逊丧父，他继承了约五千英亩（约20平方公里）的土地及数十名黑奴。杰斐逊在所继承的土地建造自宅，该地其后名为蒙地沙罗（Monticello）。
父丧后，杰斐逊在1758年至1760年间，受业于由博学的詹姆斯·毛瑞（James Maury）教士所开设的学堂。学堂位于弗雷德里克斯堡教区，距沙德维尔（Shadwell）12英哩（19公里）。杰斐逊寄宿于毛瑞家中，接受古典教育（classical education），并研习历史与自然科学。
16岁时，杰斐逊入学威廉斯堡的威廉与玛丽学院哲学系，自1760年起至1762年止，为时两年。杰斐逊追随威廉·史莫（William Small）教授，研究数学、形而上学、与哲学。史莫引导充满热情的杰斐逊接触不列颠实证主义者（British Empiricists）们的著作，包括约翰·洛克、法兰西斯·培根、以及艾萨克·牛顿爵士。（杰斐逊后称其为‘古往今来最伟大的三个人’（"three greatest men the world had ever produced"））。据闻杰斐逊的学院生涯为每日读书15小时，随身携带希腊文法书，法文精熟，练习小提琴，喜好科尔涅里乌斯‧塔西佗（Cornelius Tacitus）与荷马的著作。
杰斐逊在学院中曾为神秘的扁帽俱乐部（Flat Hat Club）之一员，学院现今的学生报纸即以此俱乐部为名。他在1762年以优秀成绩毕业后，转而跟随良师兼益友乔治·威勒（George Wythe）学习法律，于1767年取得维吉尼亚州的律师资格。
1772年，杰斐逊与守寡的玛莎·斯格尔顿（Martha Wayles Skelton, 1748-82）成婚，生下六名子女：玛莎·蓝道夫（Martha Jefferson Randolph, 1772-1836）、珍·蓝道夫（Jane Randolph, 1774-1775）、一名死产而未及命名的儿子（1777-1777）、玛丽·威勒斯（Mary Wayles, 1778-1804）、露西·伊莉沙白（Lucy Elizabeth, 1780-1781）、与露西·伊莉沙白（Lucy Elizabeth, 1782-1785）。玛莎·斯格尔顿逝于1782年9月6日，杰斐逊再未续弦。
1774年至1800年间之政治生涯
杰斐逊于维吉尼亚的城镇自治议会（House of Burgesses）中执法。他于1774年写下英属美州民权概观（A Summary View of the Rights of British America），引领维吉尼亚地方议会走向国会。这本小册成为美国人对英国殖民者们辩驳时的有力论据，促进美国人走向独立自主，标示著杰斐逊为爱国者中思想最深刻的辩士之一。
鲁道夫·伊凡斯（Rudolph Evans）所塑之杰斐逊像。后方墙上铭刻着美国独立宣言前文
杰斐逊为美国独立宣言之主要撰稿人，献身于美国的政治文化与民间文化。大陆议会为撰写该宣言所委任的五人小组全体一致同意，由杰斐逊单独起草宣言全文。
1776年9月，杰斐逊回到维吉尼亚，并获选入新成立的维吉尼亚州代表议会（Virginia House of Delegates）。杰斐逊于其任期中锐意兴革州内法制体系，以使维吉尼亚成为民主的一州。他于三年间起草126条法案，包括废除长子继承权、建立宗教自由、并使司法体系现代化。1778年，杰斐逊的‘知识大幅普及散播法案’（"Bill for the More General Diffusion of Knowledge"）促成其母校的连串学术改革，包括美国各大学中第一个成立的选修制度。
杰斐逊于1779年1781至年间任维吉尼亚州州长，在1780年以州长的身分监督维吉尼亚州治由威廉斯堡迁移至里奇蒙。他不断在威廉与玛丽学院中呼吁教育改革，包括全国首创由学生自治的荣誉法则（honor code）。1779年，在杰斐逊的指示下，威廉与玛丽学院委任乔治·威勒为美国各大学中首位法学教授。因对改革的进程不满，杰斐逊后来创立了维吉尼亚大学，为美国第一所与宗教学说完全无关的高等学院。
维吉尼亚两次在杰斐逊入主政期间遭英军入侵。杰斐逊本人几遭奇袭薛伦斯维尔（Charlottesville）的英军骑兵纵队所俘，但终能脱身。民情因政府无力御侮而激愤不已，从而几乎毁了杰斐逊的政治前途；但在约克镇之围后，民愤逐渐平复。
杰斐逊于1785年至1789年间驻节法国，未及参与合众国宪法会议（Constitutional Convention）。他其后虽逐渐支持这部新宪，却仍认为新宪因缺乏权利法案而有缺陷。
自法返国后，杰斐逊于乔治·华盛顿的政府中担任首任美国国务卿（1789-1793）。他与亚历山大·汉弥尔顿两人之间开始对全国性的金融政策展开论战，杰斐逊将汉弥尔顿与其他狂热的联邦党人与保皇党等量齐观。1790年，杰斐逊深恐其拟之为‘保皇主义’的‘汉弥尔顿主义’占上风，写下‘汉弥尔顿的信徒们跟着气喘嘘嘘…并渴求帝王之冠、诸侯之冕、与主教法冠。’ （"Hamiltonians were panting after...and itching for crowns, coronets and mitres"）杰斐逊与詹姆斯·麦迪逊创立民主共和党，并成为党内领袖。他们二人与麦迪逊的的竞选总干事约翰·贝克利（John James Beckley）所建立的体系，史称第一党系统（First Party System）。1793年，英法两国爆发战争，杰斐逊强烈支持法国，而汉弥尔顿与华盛顿方面在缔结杰伊条约（Jay Treaty）后则支持英国，杰斐逊于是辞职隐退蒙地沙罗，后又获选为美国副总统。（1797─1801）
因与法国进行准战争（两国海军不宣而战），约翰·亚当斯所领导的联邦党加强并增募海陆两军，同时开征新税，从事战争准备，并在1798年制订了客籍法和惩治叛乱法（Alien and Sedition Acts）。杰斐逊将此法解读为攻击他所属的政党，甚于对付危险外敌。他与麦迪逊为重新集结支持者，匿名著作肯塔基与维吉尼亚提案（Kentucky and Virginia Resolutions），主张宪法所建立者仅为各州与联邦政府之间的协定，联邦政府无权行使宪法无明文规定之事项，而各州对联邦政府各项僭权之举可视为无效。此提案为美国史上首次对州权论之陈述，该论述开日后拒行联邦法规与介入论之先河。
杰斐逊与纽约的艾隆·伯尔紧密合作，重新集结其政党，特别为对付新税开征而投入1800年美国总统大选。联邦党反击杰斐逊为自然神论者、无神论者、称他为基督徒之敌。杰斐逊与伯尔在选举人团中，票数并列第一，须由时为联邦党所控制的美国众议院决断选举结果。
经冗长辩论后，汉弥尔顿在众议院中说服了同党议员。他认为，选举过程中的流言将腐蚀新生的美国政府；而就政治面而言，杰斐逊较不具伤害性。众议院因于1801年2月17日决议，推举杰斐逊为总统，伯尔为副总统。
总统任内1801-1809
政策
杰斐逊于1801年至1809年间担任总统，为首位于白宫任职并离任的总统。这也是民主共和党党员首次选上总统。截至目前为止，杰斐逊为唯一担任过美国副总统后又选上总统，且任满两个任期者。
杰斐逊任内因崇尚重农主义、个人自由、有限政府、及以共和主义激励美国身份认同而知名。仅管杰斐逊他以建立有限政府目的，他在第一任的总统任期中执行路易西安纳购地案，并委派进行路易斯与克拉克探勘。杰斐逊于1804年美国总统大选中获选连任。他在第二任期中主要处理外交问题，例如在陷入英法之战时保持中立。
杰斐逊本是严谨建构主义者，但在其总统任内对自己的原则妥协。他在保持小型海军、农业经济、严谨建构主义、与小政府等原则上退缩。自民主共和党分离而出的特挺奎德斯（Tertium quids）团体指责杰斐逊自毁原则。
总统任期中的事件
* 第一次巴巴利战争（1801-1805）
* 路易西安纳购地（1803）
* Marbury v. Madison（1803）
* 成立奥勒冈属地（1804）
* 伯尔谋叛（1805）
* 1804年土地法
* 批准美国宪法第廿修正案（1804）
* 路易斯与克拉克探勘（1804-1806）
* 1805年成立路易西安纳属地（后更名为密苏里属地）
* 特挺奎德斯自民主共和党中分离而出。
* Embargo Act of 1807年禁运法案，企图与拿破仑战争中的交战国中止贸易关系以令美国的中立国地位获得尊重。
* 1808年废除国内奴隶贸易。
政府与内阁
职位 姓名 任期
美国总统 托马斯·杰斐逊 1801–1809
美国副总统 艾伦·伯尔 1801–1805
乔治·克林顿 1805–1809
美国国务卿 詹姆斯·麦迪逊 1801–1809
美国财政部长 山缪·德斯特 1801
阿尔伯特·高勒挺 1801–1809
美国战争部长 亨利·迪尔绷 1801–1809
美国检查总长 李维·林肯 1801–1804
罗伯特·史密斯 1805
约翰·布瑞肯里吉 1805–1806
凯撒·奥古斯都·罗德内 1807–1809
美国邮政总长 约瑟夫·哈伯夏姆 1801
吉登·古兰格 1801–1809
美国海军部长 班哲明·史都德特 1801
罗伯特·史密斯 1801–1810
最高法院大法官任命案
杰斐逊于总统任期内任命下列美国最高法院大法官。
* 威廉·强森（William Johnson） – 1804年
* 亨利·李文斯顿（Henry Brockholst Livingston） – 1807年
* 托马斯·陶德（Thomas Todd） – 1807年
于任期中加入联邦的州
* 俄亥俄 – 1803年
创建大学
维吉尼亚大学圆厅
杰斐逊卸任总统职务后仍持续活跃于公共事务中。他投入大部分的心力以成立一所新的高等院校，专于解除教会对校务的影响，使学生可专心致力于他所大学所无法提供的新天地中。在一封1800年由他寄给约瑟夫·普利斯特利的信函中，表明他在真正建立一所大学前已为此思考了数十年之久。
他的梦想于1819年因维吉尼亚大学的成立而实现，州议会批准每年拨款1,500美元以供兴学之用。该校于1825年开始招生时，是第一所提供学生全部选修课程的大学（尽管首届仅有30名学生入学）；而校区则是当时北美洲最大的建筑案之一。值得注意的是，该校校园以图书馆为中心，而非教堂。其实，原案中根本就没有包含校园礼拜堂在内。杰斐逊生前常邀访学校师生职员至家中，艾德加·爱伦·坡为当时的访客之一。
维吉尼亚大学经设计为州内最高学府。杰斐逊的看法认为，州内居民皆可经由单一共同的评断标准入学。
逝世
杰斐逊逝于1826年7月4日，当日为独立宣言通过五十周年纪念日，与约翰·亚当斯同日去世。杰斐逊生前因创校而债务沉重，美国各地曾捐输约1,6000美元以帮助这位前总统，但不足以助其清偿债物与医疗费用。杰斐逊552英亩（223公亩）的产业于1831年在蒙地沙罗的一次拍卖会上，以美金$7,000元售予詹姆斯·巴克礼（James T. Barclay）。1836年，巴克礼将地上物连同218英亩（88公亩）的土地以$2,700转售给美国海军的尤瑞亚·李威中尉。李威中尉后来买下周围的土地及屋内家具陈设，他因而获称‘蒙地沙罗的救星’。李威中尉于1862年因美国内战而去世，遗嘱中将蒙地沙罗捐赠给美国政府作为海军遗孤的学校。托马斯·杰斐逊身后葬于其蒙地沙罗的产业上，其墓志铭由他在生前自行写就。他坚决要求，墓碑除铭刻自己所撰写的句子外，‘一个字也不要多’。墓志铭如下：
维吉尼亚大学
之父 以及
维吉尼亚
宗教自由法
美国独立
宣言
作者
托马斯·杰斐逊
长眠于此
HERE WAS BURIED
THOMAS JEFFERSON
AUTHOR OF THE
DECLARATION
OF
AMERICAN INDEPENDENCE
OF THE
STATUTE OF VIRGINIA
FOR
RELIGIOUS FREEDOM
AND FATHER OF THE
UNIVERSITY OF VIRGINIA
杰斐逊之墓
外貌与人品
杰斐逊身高六呎二吋半（189厘米），体型修长健壮；脸部轮廓棱角分明，气色十分红润，发色金赤，间杂淡褐；灰色眼珠；晚年衣着随便，不修边幅。杰斐逊是个糟糕的公众演说者，他大部分的重要演说都是咕哝著带过；尽管如此，他认真演说时举止优雅。杰斐逊与他人很快便能相互热络（但对陌生人并不十分友善）；而他富朝气、跳跃式、知识性的言谈充满魅力。在安静的外表下，他热情执著而多愁善感，好似在大小事上都有规律性的习惯动作。1801年，他遭英国首相蓄意侮辱，而在华盛顿建立谋划中心作为回应。
虽然传记中称他缺乏幽默感，他最喜欢的读物似乎是《唐吉诃德》与《莫里哀》。而虽然他的著作中充塞著功利思想，他年轻时则充满浪漫主义，曾为了翻译莪相（Ossian）之诗准备学习盖尔语，并为取得原稿而拜访詹姆斯·麦克佛森（James Macpherson）。
他于任内中止总统亲自演说国情咨文的作法，而是将讲稿送达国会（至伍德罗·威尔逊任内方恢复由总统亲自演说）。他在总统任内仅进行了两次公开演说。妻子亡故后，他焚毁两人之间往来的书信，显现出一个人有时可以孤僻到什么程度。
近代由诺姆·列俊（Norm Ledgin）所著之《诊断杰斐逊》（Diagnosing Jefferson）一书曾暗示，杰斐逊带有亚斯伯格综合症。有些史家抨击这项发现，他们认为身患此疾‘会减损杰斐逊的伟大崇高’。然而，心理学家们认为，书中所描写的人格特质与阿斯伯特综合症的患者高度相符。（Ledgin 2000）
兴趣与活动
蒙特沙罗
杰斐逊是深具造诣的建筑师，他将英国在辉格党权贵中广受欢迎的帕拉第奥建筑风格（Palladian architecture）带入美国，因而对后世的美式建筑风格影响深远，此种风格与共和党对于市民美德与政治自由的启蒙思想有关。杰斐逊所设计的蒙地沙罗自宅声名远播，宅内有自动门、首次面世的旋转椅、及许多杰斐逊自己发明的便利装置。左近的维吉尼亚大学是美国唯一一所由总统所创建的高等学府，其教案与建案全由杰斐逊一手包办。时至今日，蒙地沙罗与维吉尼亚大学已共同成为美国境内仅有的四处文化世界遗产之一。杰斐逊对维吉尼亚州议会山庄的建筑设计亦有贡献，该建筑以法国南部尼姆（Nîmes）的古罗马式庙宇─方堂（Maison Carrée）为原型。杰斐逊的建案开启了美国后续的联邦式建筑风潮。
杰斐逊的的爱好之一是考古学，可追溯至幼年时所接受的训练。杰斐逊有时被尊为考古学之父，以表彰他在发展文物发掘技术上的角色。当他于1784年在自家产业内发掘出一处印地安人坟冢时，并未依循当时的一般性作法─即不断下挖，直至文物出土为止──而是在坟冢上开出仅可容身的缺口，以便入内研究。
蒙特沙罗的鱼塘
杰斐逊颇为喜爱自家的鱼塘。鱼塘呈钵型，深约三英呎（一米），用以留置他所捕获的水族。该鱼塘今已重建，位于蒙地沙罗西边。
杰斐逊好品酒，曾于驻法国时（1784年─1789年）广游欧洲各大产酒区，并运送佳酿回乡。并曾作出广为人知的大胆宣言：‘我们可以在美国酿出与欧洲多样风味相捋的佳酿，不会是一模一样，但无疑是相同的甘美。’蒙地沙罗曾经广植葡萄，其中有很大一部分是欧洲品种的酿酒葡萄。全部葡萄后来皆未能幸免于美洲原生种的葡萄疾病。
他于1812年写就的国会议事初步（A Manual of Parliamentary Practice）至今仍持续使用中。
华盛顿特区连同国会图书馆于1814年遭英军焚毁后，杰斐逊将个人藏书提供给国家。国会慨然接受，拨款$23,950元以收购其价值五万元的6,487部藏书，为国家的大图书馆奠基，亦部分抒解杰斐逊之财务困境。时至今日，国会图书馆网站上的联邦立法资讯名为托马斯，以表彰其贡献。
他另身兼美国哲学协会（American Philosophical Society）会长，任职多年。
政治理念
在其1818年5月28日致末底改·曼纽·诺亚（Mordecai Manuel Noah）之信函中，杰斐逊阐释其对人类信条与对民主的本质之看法
杰斐逊对美国的愿景为以农立国，耕者有其田，恰与约翰·亚当斯及亚历山大·汉弥尔顿为代表的联邦党看法相对立。汉弥尔顿展望美国成为商业与制造业国家，被视为美国卓异主义之父的杰斐逊则衷心相信美国的独特性与无穷潜力。也就是说，杰斐逊自信满满地认为，美国这样地广人稀的国家足以避免他所忧惧的，欧洲式阶级对立与工业化。
杰斐逊受多名欧洲启蒙思想家的见解影响极深，其政治原则来自约翰·洛克（尤其是不可转让之权利（inalienable rights）与人民主权（popular sovereignty））与托马斯·潘恩（Thomas Paine）的常识。政治学家将杰斐逊的思想拟之于与其同时的卢梭（Jean-Jacques Rousseau）杰斐逊相信，人皆拥有‘某种不可转让之权利’。也就是说，无论政府是否存在，人所拥有，不可创造、夺取、或转让的基本权利永存。杰斐逊对于自由的解释最受重视，他将之定义为‘正当的自由为，在其他人据相同权利划定之范围内，依我等之意愿畅行无碍。我并未加述“合法范围内”，因律法通常不过是专制独裁者之意图，而律法的确就是这样侵犯个人权利。’（"rightful liberty is unobstructed action according to our will within limits drawn around us by the equal rights of others. I do not add ‘within the limits of the law’，because law is often but the tyrant’s will, and always so when it violates the rights of the individual."）因而，对杰斐逊来说，政府不仅不能‘创造’自由权利，反而有可能侵犯个人自由。而适切自由的范围并非由法律所规定，而是止于他人有相同权利之处。杰斐逊认为，适切的政府不仅要防止个人侵害群体中其他人之自由，也要自我限制以防削弱个人自由。
杰斐逊经由成功废止维吉尼亚的长子继承权实现他对平等的承诺。此法规定唯长男可继承所有家族土地。他在一封1785年写给麦迪逊的书信中解释其观点：
Cquote1.png 我的确了解，均分地产不切实际，但土地分配的极度不平等造成了许多人的不幸。对于产业的再分割，立法机构就算立再多的法条也不够，只是让分割过的土地以人类的自然天性代代相传。将土地由所有子孙、所有兄弟姐妹、乃至其他具有亲戚关系者，均分继承，为精巧而可行的法案。减轻地产分配的不公平性的另一重意义为避免赋税征及过低之点，并可以几何级数增收大面积土地的赋税。目前的土地法，对乡村野地或无业穷人的天赋权利皆大有侵害。地球经赐予作为人们工作与生活的共有蓄积。我们若以工业化为适切，并加以奖励，便必须照顾被排除在职场之外者；若否，则应归还其于地球上工作的基本权利。我们的社会，要让所有无业者找到无主荒地以耕种并付适切地租还为时过早，但尽可能让所有人不致连一小块地都没有则非是。小地主是国家最珍贵的部分。 Cquote2.png
杰斐逊相信，人生而有分辨是非善恶的道德观，以与他人相处─即无论是否自我约束，人生而了解他人之天赋权利。他甚至相信，天赋的道德感足以信赖，而小规模的无政府社会因此可以运行良好。他曾在若干场合中阐述印地安人的无政府社会之管理：
他在《致凯灵顿上校的信》中写道：‘我确信，这些（印地安）无政府社会内的一般民众，较之于欧洲各国政府治下者，享有更大程度的满足。’杰斐逊相信，无政府主义‘与大规模的人口扞格不入。’。他因而倡议，美国仅能因‘人民同意接受治理’，而在扩张后的版图上建立政府。
在美国独立宣言的草稿中，杰斐逊在序文内写道：
Cquote1.png 吾等认为，以下事实神圣不容否认：人生而平等且独立自主；平等而生并取得无可转让之权利，包含维持生活、自由、与对幸福的追求。为达此目的，于人民之中建立之政府，经受治理者之同意而司法。任何型式的政府，若坏此标的，则人民有权改组或废弃之，并另立本诸前述原则所组织而成之新政府型式，一如人民应以最大努力追寻安全与幸福。 Cquote2.png
杰斐逊对‘受治理者之同意’着墨极深。他相信，个人不能因过去世代的作为而受到包含债务与法规在内的道德束缚。他说道：‘没有任何社会可制订永久性的宪法或法律，地球永属生活于其上之世代。’他甚至计算出他所认为适切的法定周期：‘因而所有的宪法，以至所有律法，自应于19年后届满失效。若行使更长久的时间，则成为强迫性，而非权利性的作为。’杰斐逊所估计出的19年来自当时的预期寿命表，他所认为这就是个人有能力作自我表达的‘成熟’年龄。。杰斐逊也呼吁消除国债。他相信当前的世代毋须在道义上偿还前人之负债。他说道，承担这样的债务为‘慷慨作为，而非权利上的问题。’.
杰斐逊极为拥护州权，其于1798年之维吉尼亚和肯塔基决议（Virginia and Kentucky Resolutions）中，订下敌视联邦扩权之基调，尤其值得注意。然而，他的若干外交政策实际上反而扩充了联邦权力。其中最重要的是，他在1803年的路易西安那购地案中，以不成文的联邦权力兼并一大块外国土地，连同居住其间的法籍与意大利居民。他行使禁运法案，却因与外交政策抵触而失效，显示联邦政府在有战争之虞时，可以强大武力作为后盾，介入地方层级事务以控制贸易往来。
对司法的观点
杰斐逊虽为受过训练的律师，但从未在法庭中感到自在。他认为法官应为技术性专家，不能设定政策。他谴责最高法院于1801年在马布瑞对麦迪逊（Marbury v. Madison）一案中的判决为违反民主，但无法在国会中取得足额支持以提出宪法修正案来驳回该判决。他持续司法违宪审查（judicial review）的说法：
Cquote1.png 以法官为一切宪政疑义之最高仲裁者之说法十分危险，任何释宪的法官皆可置我等于寡头独裁之下。我们的法官既与常人一般正直，亦无逾常人。法官们对党派、权力、与自身特权之偏好，亦无异于人，其格言为boni judicis est ampliare jurisdictionem─‘广为管辖即正义’。他们的权力最是危险，因其为终身职，且不如其他部门一般对选民负责。依宪法设立的法庭，非以交付予任何弊端随时发生、成员专制的党派；而是更明智地令其所有部门平等共治。
对宗教的观点
杰斐逊于1800年曾遭政敌指称为无神论者、宗教之敌，但杰斐逊在宗教方面著作颇丰，而大多数为其立传者皆同意杰斐逊为为自然神论者，即18世纪晚期当时欧洲知识份子一般所抱持的观点。罗马天主教的神学领袖艾佛略·杜勒斯枢机主教（Avery Cardinal Dulles）曾说：‘杰斐逊在威廉与玛丽学院的生涯中，以法兰西斯·培根、艾萨克·牛顿、约翰·洛克为三位智慧典范。而在数名教授的影响下成为自然神论的哲学家。’杜勒斯总结道：
总而言之，杰斐逊之成为自然神论论者，是因为他信奉独一的上帝、信从天命、相信天行有常与死后的审判，而非信服于超自然。杰斐逊视基督教为自然宗教的最终解释，以耶稣基督为无与伦比的道德导师，因而成为基督教徒。他拒绝信仰正统基督教，也拒绝相信教义中所称，基督为上帝之子的肉身，为命定救主等观点。杰斐逊的宗教信仰差不多就是当时的美国式自然宗教。
传记作家彼得森（Peterson）总结杰斐逊的神学观点如下：
首先，基督教各教派的教义不合情理，因而不足为凭，但却以之剥夺了祭司的圣礼、仪式、与教条，以之重新解释历史实证之光与人类的经验；又以不足采信，而基督徒理应遵守之圣经式宇宙观，取代笃信科学者的宇宙观。其次，道德感毋须神明之认可或激励，毋须诉诸六合之外，说不定甚至毋须诉诸对天堂之盼望与对地狱之恐惧，基督教之天启伟业因而翻落至尘世中。
杰斐逊持续使用自然宗教式之字汇描述造物主，而美国独立宣言中使用的也是诸如‘造物者’（"Creator"）、‘自然界之造物主’（"Nature's God "）等词句。杰斐逊进一步相信，此造物主以‘生活、自由、与追寻幸福’等数种不可转让之权利塑造人性。就其于革命前居法的经验，他深切疑虑，（天主教）牧师们与主教们为无知的反动势力。
杰斐逊受英国国教派哺育成长，该教派时为维吉尼亚之法定宗教，是唯一由政府资助的教派。杰斐逊于革命前为地方上的教区代表，在当时为具公职身分之职位。他稍后表明，大致上同意其友约瑟夫·普里斯特利（Joseph Priestley）之上帝一位论。杰斐逊在一封致俄亥俄州先驱者的信中写道：‘我甚感欣喜，此一疑信自便，得神庇佑之国度，不向政教任何一方作道义上的妥协。真神仅只一位，此一真理业已复苏；而我确信，合众国内所有青年，最终定成一位论之信徒。’
杰斐逊不相信耶稣之神性，但十分尊崇耶稣之道德教诲，视之为‘自然神论之宗旨，及上帝之特质之义理，用以改革[修道院犹太人]（prior Jewish）之道德学说，以达理性、正义、与慈爱之标准，并谆谆教诲对将来国度之信仰。’"
一如众自然神论者，杰斐逊不相信神迹。他自制的简要版福音书中，大部分仅有他所认可之耶稣之道德哲学。这本杰斐逊版圣经于其身故后发行。
‘此文书（杰斐逊版圣经）证明我乃“真基督徒”，即耶稣的教导之信徒，不同于称“我”为异教徒并“自”称为基督徒与布导家的柏拉图派学者们，其于作者未曾目睹口说之处抽取独有之教条。’
杰斐逊对基督教作了许多批判。一些著名的观点如下：
“我最近已经检查了世界上所有所知的迷信，在我们特有的基督迷信中我没发现赎罪这一特点。他们都是建立在神秘传说之上。百万计的无辜男女，因为基督教的劝导，被焚烧、折磨、处罚和禁闭。这种威权的作用何在？让一半人成为傻瓜，另一半成为伪君子，去支持地球上的欺诈和谬误。”
“基督教的神是三个头的妖魔，残忍、报复心重、反复无常。如果一个人想要更多了解这个狂怒的、三头畜牲般的神，这个人只需要看声称做它仆从的人们的器量。他们总是在这两类人中：白痴和伪善者。”
“总有一天，所谓耶稣以上帝为父，在处女的子宫中神秘诞生的说法，将与弥涅耳瓦从朱比特的脑中诞生的说法一样，被视为寓言。”
“基督教是曾经照射人类的体系中最不正当的体系。”
政教关系
杰斐逊于革命期间领导维吉尼亚实行政教分离。英国国教派当时受维吉尼亚州府资助，而杰斐逊在‘维吉尼亚照会’（Notes on Virginia）中，取消以下法条：‘若有人提及基督徒否认上帝或三位一体之存在…应受惩处。首先，取消任公职之资格…其次，限制收受礼物或遗赠…并入狱三年。’前此担任公职者，据信连同杰斐逊本人在内，必须宣誓不相信罗马天主教的圣餐变体学说。1779年，杰斐逊完成‘建立宗教自由之议’初稿，并视此案之通过为高度成就。对他而言，政教分离不仅是抽象的观念，而是对基督教各派互以他派为异端的宗教性‘专制’之必要性改革。
自1784年至1786年，杰斐逊与詹姆斯·麦迪逊联手反对派崔克·亨利（Patrick Henry）让维吉尼亚州府再次资助宗教的企图。1786年，维吉尼亚大会（Virginia General Assembly）通过杰斐逊的宗教自由法案，该案于1779年送审，为杰斐逊自撰于墓志铭上之三大生涯成就之一。法案中规定：
无人应被迫惯常地支持任何宗教之仪式、场合、或神职人员；在人身上及其所有物上亦皆不应受强制、受拘束、受妨碍、或受重荷，亦不应因其宗教观点或信仰而受罚；而所有人应可自由宣誓入教，以论证来维护其宗教观点，同样也不应因其智愚而贬损、增加、或影响其公民权。
杰斐逊认为，他所说的‘政教阻隔之墙’的原则已阐示于美国宪法第一修正案中。美国最高法院多次引用此词以释义国教条款。在一封于1802年致康乃迪克丹伯里（Danbury）浸信会的信函中，杰斐逊写道：
要相信，宗教为个人与其神明间之事，个人不因其信仰或行礼拜而负欠他人，政府之立法权仅及于行为，而不及于思想，我以对主权之崇敬忖度全美民众之作为，宣告其立法机构应“不立任何有关设定国教之律法，或禁制行使之自由”，依此于政教之间设立阻隔之墙。’
他于1808年致维吉尼亚浸信会之信函中，再度使用‘阻隔之墙’一词：
因宗教信仰，或无信仰，为人人生活中重要之一部分，宗教自由影响所有人。国教者，以政府力量支持自身，并将自身观点强加于具他种信仰，腐蚀我全民之民权。另外，政府所支持之宗教，易使其神职人员远离教众，及使宗教内部之腐化。因而，竖立“政教之间阻隔之墙”完全为自由社会之根本。
我们已解决…有趣的大问题，就是宗教自由是否与政府之政令及遵行律法相容。并且，我们体验到，让各人就自身理由并认真地说服自身疑问，自由开放地宣誓入教，如此原则，所带来的宁静与舒适。
杰斐逊于任职总统期间，拒绝宣布祈祷日与感恩节。甚且其私人信函显示对神职人员过度干涉俗世之政府事务持怀疑态度。在信中，他写下自身之观察：‘我相信，历史上未曾有以教领政的自由民权政府。’，且‘神职人员于何时何地皆为自由之敌，向与专制君主之结盟，煽动其滥权以获得自身之保障。’‘愿世界得知，我相信，（对某些快些，对某些迟些，但最终对所有人而言）即将来临之觉醒将打断因无知修士与迷信而自我捆绑之锁链，代之以自我管理所得之赐福与保障。’。杰斐逊最为刺耳之评论，似直指继承约翰·喀尔文精神者：
重大的敌人为“不同教派之牧师”，对其而言，人类心灵之增长乃不祥之兆。其道坛轰鸣著对委任考伯博士（Dr. Cooper）之斥责。考伯博士遭控指为反对三位异体说之保皇党。虽对彼此的观点互怀敌意，这些教派相混以维持自身神秘的教义以对抗信奉唯一真神者。“长老派神职人士最为嘈杂，最不能宽容其他教派，最是专横而野心勃勃。”立法者们已备好言词，这些言词若为人所得，在此一未遭玷污的半球点火，喀尔文圣谕中之火焰将吞没可怜的麦可·塞尔维特（Michael Servetus）。
杰斐逊渴求树起‘政教阻隔之墙’，但并不要求约制公职人员的宗教生涯。杰斐逊本人曾参加基督教公共服务，包含在任总统期间，众议院的每周教会服务。他有担任神职的朋友，并以金钱资助若干教会。如同自然神论者约翰·洛克一般，杰斐逊个人相信天赋人权：‘一国之自由可否说是安稳，若我们移走其唯一之坚实基础，即自由天赐之信念？我甚为我国焦虑，因我认为天道好还，而天意当非永睡不醒。’.
杰斐逊与奴隶制度
纪录显示，杰斐逊一生中曾拥有逾650名奴隶，其中有是自双亲及妻方继承而来，也有许多是因债权而扣留之资产。他既公开坦承相信奴隶制度不人道且终将绝迹，又蓄奴之行为，遭目为伪善。1801年，在总统大选过后，波士顿的报纸《新英格兰守护者》（The New England Palladium）报道，杰斐逊‘骑在奴隶背上进入自由之殿堂。’
美国独立宣言初稿中，杰斐逊谴责英王在北殖民地主导引入奴隶制度，控诉英王‘从事残酷的战争以压制人性，对未曾冒渎他的人们，侵犯其生命与自由两个最庄严的权利，蛊惑并运载他们到地球的另一边成为奴隶。’这段话在南卡罗莱纳与乔治亚的代表们要求下，自独立宣言的正文中删除。1769年，当时身为维吉尼亚州议会代表之杰斐逊，提案解放州内之奴隶未成。1778年，州议会通过他另一项提案，维吉尼亚禁止输入奴隶。用他本人的话说，此案虽未带来全面解放，但‘禁绝因输入奴隶而提高恶行，将最终的根绝留给未来。’1784年，杰斐逊在西北地域法令初稿中规定，自西北属地中新加入联邦的州‘既不可蓄奴，亦不可奴役非自愿受者。’.1784年，杰斐逊在其维吉尼亚照会中抨击奴隶制度：
我国民生产中掺杂奴工定有令人不快之影响。主奴间所有的交易都是狂怒下的无限期作法，对其中一方为不懈怠的专制，对另一方则为卑下屈从。’
史家史蒂芬·安伯洛斯称：
杰斐逊明知奴隶制度不当，明知自己自此种体制中得利为不道德，但在其一生中显然看不到放弃的迹象…在杰斐逊矛盾的一生中，没什么比这个更矛盾的了。
莎丽·海明斯（Sally Hemings）的争议
自杰斐逊在世时便争议不断的一个题材是，他是否为其女奴莎丽·海明斯子女之父？此一说法自1802年起广泛得到公众关注。记者詹姆斯·科连德（James T. Callender）于里奇蒙的地方报刊中写道，海明斯曾为杰斐逊之‘妾室’，长达数年之久，并为杰斐逊生下多名子女。。杰斐逊未曾对此作任何公开回应，但其遗嘱中要求予海明斯之两子，艾斯顿（Eston）与麦迪逊·海明斯（Madison Hemings），自由之身。两人后来声称杰斐逊为其生父。
1998年，一项对其去氧核糖核酸的研究，断定海明斯与杰斐逊两个家族间具有ＤＮＡ上的连结，但无法确证托马斯·杰斐逊本人为海明斯家族之始祖。三项研究成果于2000年代初期发布，并公开出版。在蒙地沙罗运作的托马斯·杰斐逊基金会（Thomas Jefferson Foundation）声明‘不太可能是…杰斐逊家族内的其他人，而非托马斯·杰斐逊本人，为海明斯子女之父。’托马斯·杰斐逊遗产协会（Thomas Jefferson Heritage Society）下属一个研究委员会，由13名独立成员所组成的学者委员会领导，断言，以杰斐逊本人为其始祖的理论站不住脚。‘全国宗谱协会季刊’（National Genealogical Society Quarterly）稍后发文评论，莎丽·海明斯与托马斯·杰斐逊两人间的的关系证据确凿。.
纪念馆与纪念物
* 1943年4月13日，即杰斐逊生辰两百年纪念日，杰斐逊纪念馆（Jefferson Memorial）落成于华盛顿特区。该纪念馆由新古典（neo-classical）式的碟型低屋顶与柱廊构成，其内树19英呎高的杰斐逊像，并雕有其著作之若干章节。最突出者为铭刻于屋顶近处，环绕纪念馆之文字：‘我于上帝之祭坛上誓言与宰制人类心灵的所有暴政为敌。’
* 卡文·柯立芝总统选定杰斐逊与乔治·华盛顿、西奥多·罗斯福、及亚伯拉罕·林肯四位总统之头像，勒石于拉许摩尔山（Mount Rushmore）山巅。
美金二元钞票
* 美金二元钞票、美金五分钱硬币、以及美国国库券的百元券上，都印有杰斐逊之肖像。
* 杰斐逊纪念教堂（一神普教论者（Unitarian Universalist））位于维吉尼亚州的薛伦斯维尔（Charlottesville）
* 2003年7月8日，美国全国海洋暨大气总署（National. Oceanic and Atmospheric Administration, NOAA）之船只‘托马斯·杰斐逊号’于维吉尼亚诺福克港下水服役，以纪念其对海岸线之研究，即总署下辖之国家海洋局（National Ocean Service）之前身。
轶事
* 签署独立宣言的众先贤中，日后当选总统者仅有杰斐逊与约翰·亚当斯两位。
* 1826年7月4日，即独立宣言获正式采用的五十周年纪念，亚当斯逝于昆西市，其著名之遗言为‘托马斯·杰斐逊还活着。’杰斐逊其实早他数小时撒手人寰，但亚当斯并不知情。
* 杰斐逊最广为引述的警句‘管得最少，就是最好的政府。’（"That government is best which governs least"）其实根本不是出自杰斐逊。而出于亨利·大卫·梭罗对于公民抵抗的说法， 自其合众国期刊与民主评论（The United States Magazine and Democratic Review）警句‘最好的政府是管得最少的’（“The best government is that which governs least.”）改写而成。
As a political philosopher, Jefferson was a man of the Enlightenment and knew many intellectual leaders in Britain and France. He idealized the independent yeoman farmer as exemplar of republican virtues, distrusted cities and financiers, and favored states' rights and a strictly limited federal government. Jefferson supported the separation of church and state and was the author of the Virginia Statute for Religious Freedom (1779, 1786). He was the eponym of Jeffersonian democracy and the co-founder and leader of the Democratic-Republican Party, which dominated American politics for 25 years. Jefferson served as the wartime Governor of Virginia (1779–1781), first United States Secretary of State (1789–1793), and second Vice President (1797–1801).
A polymath, Jefferson achieved distinction as, among other things, a horticulturist, statesman, architect, archaeologist, paleontologist, inventor, and founder of the University of Virginia. When President John F. Kennedy welcomed 49 Nobel Prize winners to the White House in 1962 he said, "I think this is the most extraordinary collection of talent and of human knowledge that has ever been gathered together at the White House – with the possible exception of when Thomas Jefferson dined alone." To date, Jefferson is the only president to serve two full terms in office without vetoing a single bill of Congress. Jefferson has been consistently ranked by scholars as one of the greatest of U.S. presidents.
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