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第五十一回　李逵打死殷天赐　柴进失陷高唐州: : 斯不得不用学究之料劫也。
第五十二回　戴宗二取公孙胜　李逵独劈罗真人: : 话说当下吴学究对宋公明说道：“要破此法，只除非快教人去蓟州寻取公孙胜
第五十三回　入云龙斗法破高廉　黑旋风下井救柴进: : 宋公明 、吴学究、公孙胜三骑马直到军前，摇旗擂鼓，呐喊筛锣，杀到城下来
第五十四回　高太尉大兴三路兵　呼延灼摆布连环马: : 而学究借作续貂之本。
第五十五回　吴用使时迁偷甲　汤隆赚徐宁上山: : 宋江笑道：“此计大妙！”吴学究道：“再用得三个人，同上京走一遭。
第五十六回　徐宁教使钩镰枪　宋江大破连环马: : 此法如何？”吴学究道：【金夹批： 本是吴用调拨，此反书作吴用答，是春秋
第五十七回　三山聚义打青州　众虎同心归水泊: : 吴学究笑道：“此人可力敌，可用智擒。
第五十八回　吴用赚金铃吊挂　宋江闹西岳华山: : ”吴学究道：“明日且去城边看那城池如何，却再商量。
第五十九回　公孙胜芒砀山降魔　晁天王曾头市中箭: : 何不书宋江等众人五字耶？】吴学究谏道：【金夹批： 又大书吴用谏，以见宋
第六十回　吴用智赚玉麒麟　张顺夜闹金沙渡: : 吴学究别了卢俊义，引了李逵，迳出城来；
第六十一回　放冷箭燕青救主　劫法场石秀跳楼: : 】吴学究大笑道：“不曾见这般请客的，【容夹批： 好。
第六十二回　宋江兵打大名城　关胜议取梁山泊: : 原来这没头帖子却是吴学究闻得燕青杨雄报信。
第六十六回　宋江赏马步三军　关胜降水火二将: : 也不来追究；
第六十九回　没羽箭飞石打英雄　宋公明弃粮擒壮士: : ：“卢俊义直如此无缘！特地教吴学究、公孙胜都去帮他，【袁夹批： 照破。
第七十回　忠义堂石碣受天文　梁山泊英雄惊恶梦: : 黑旋风李逵　天微星九纹龙史进　天究星没遮拦穆弘
第七十一回　梁山泊英雄排座次　宋公明慷慨话宿愿: : 只说宋江与军师吴学究，朱武等计议，堂上要立一面牌额，大书“忠义堂”三字
第七十六回　吴加亮布四斗五方旗　宋公明排九宫八卦阵: : 有道军师“智多星”吴学究，马上手擎羽扇，腰悬两条铜链。
第七十九回　刘唐放火烧战船　宋江两败高太尉: : 安得不终身为老学究？】倘或宋江以下有智谋之人识破，翻变起来，深为未便。
第八十二回　梁山泊分金大买市　宋公明全伙受招安: : 惟有吴学究纶巾羽服，公孙胜鹤氅道袍，【容夹：好看。
第八十三回　宋公明奉诏破大辽　陈桥驿滴泪斩小卒: : 吴学究道：“省院甚是不喜我等，今又做得这件事来，正中了他的机会。
第八十五回　宋公明夜度益津关　吴学究智取文安县
第八十五回　宋公明夜度益津关　吴学究智取文安县: : ：“苦也！”说道：“约下军师吴学究同来归顺大辽，不想来的慌速，不曾等的
第八十六回　宋公明大战独鹿山　卢俊义兵陷青石峪: : 军师吴学究说道：“可乘此机会，就好取幽州。
第八十八回　颜统军阵列混天象　宋公明梦授玄女法: : 真是学究气。
第八十九回　宋公明破阵成功　宿太尉颁恩降诏: : 罔究纲常之礼。
第九十三回　李逵梦闹天池　宋江兵分两路: : 吴学究，计议兵分两路，东西进征：东一路渡壶关，取昭德，繇潞城，榆社，直
第九十四回　关胜义降三将　李逵莽陷众人: : 宋先锋与吴学究统领其余将佐，拔寨起行，离昭德城南十里下寨不题。
第九十六回　幻魔君术窘五龙山　入云龙兵围百谷岭: : 即与吴学究计议攻城；
第一百零七回　宋江大胜纪山军　朱武打破六花阵: : 与吴学究计议道：“似此怎么打得荆南？”吴用叠着两个指头，画出一条计策，
第一百零八回　乔道清兴雾取城　小旋风藏炮击贼: : 众人与吴学究叙礼毕，卢俊义连忙说萧让等被掳之事。
第一百一十回　燕青秋林渡射　宋江东京城献俘: : 来见军师吴学究，报知此事。
第一百一十四回　宁海军宋江吊孝　涌金门张顺归神: : 这三、四个又是甚人？”和吴学究议论不定，坐而待旦，绝不见城中动静，心中