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伊奘诺尊与伊奘冉尊的结合及诸岛的形成
自天上降临
根据日本神话，伊奘诺尊、伊奘冉尊二神受天神的命令，把漂浮于海上的大地固定下来。二神便站在天上称为“天浮桥”的地方，用“天之琼矛”伸入海中搅拌，提起时，矛尖滴下的水凝聚成岛，称“磤驭虑嶋”（此据《日本书纪》；《古事记》作淤能棋吕岛），两位神灵因而“降居彼嶋”。
* 学者阐释：日本学者武光诚认为，“磤驭虑嶋”是实际上不存在的岛屿，而这则神话的来源，则有可能本是南方太平洋的波利尼西亚、密克罗尼西亚、美拉尼西亚一带“陆地是鱼变成”的神话。流传到日本的淡路岛附近，改编成为对伊奘诺尊的崇拜。
结合
二神降临后，便决定结为夫妇。于是立“国中之柱”，双方约定，伊奘诺尊从左转，伊奘冉尊从右转。约好后，当绕过柱时，伊奘冉尊便唱道：“憙哉，遇可美少男焉。”伊奘诺尊认为自己是男性，应该先唱，否则不祥，便重新绕柱一次，这次由伊奘诺尊先唱道：“憙哉，遇可美少女焉。”然后，伊奘诺尊决定用自己身上的雄元之处，合于伊奘冉尊身上的雌元之处，但“不知其术，时有鹡鸰，飞来摇其首尾。二神见而学之，即得交道”，于是“阴阳始交媾合为夫妇”。
* 学者阐释：日本文学学者谢六逸认为《古事记》等书对于二神交合的记述方式，反映了古代日本民俗的坦率朴实，因“原始的民族，他们还没有披上道德、伦理的外衣，所以会大胆的说出来。”武光诚则认为，伊奘冉尊绕过柱是因先唱而被视为不祥，在南半球亦有类似的神话，通常是代表举行祭典或施行咒术的重要性，而在日本则是“必须以男性为中心经营家庭”的训示。
生下万物、诸岛及众神
二神结成夫妇后，便生下“八大洲”及多个海岛，接着生下与生活上各种事物的神灵，如石头、泥土、砂子、河、海、水、山、树、雾、船、食物，日神、月読则较后生下，最后伊奘冉尊生下火神时，却反被烧死，伊奘诺尊遂愤而斩杀火神。
* 学者阐释：武光诚对于二神生下万物诸神的神话，作出分析，例如所谓的“八大洲”，或许是一个概略性的美称词汇，意为“由众多岛屿汇集而成的壮丽之国”。此外，《日本书纪》里所说自然万物的神灵出生的次序，是经过刻意安排，先生下山川草木等一般自然事物的神，然后再生“天下之主”，出现神格最高的太阳神。而火神是最后诞生，是因为古人知道火一方面可创造文明，另一方面可毁灭一切，不易掌握。当人类智慧进步到对火运用自如时，便期望火神出现，因而把它的诞生放到最后。
与伊奘冉尊决裂
伊奘诺尊因舍不得妻子伊奘冉尊，追至黄泉，伊奘冉尊便警告他不要看望自己。伊奘诺尊不听，当看到她时，已经是“脓沸虫流”，面貌恐怖，伊奘诺尊大惊而逃。伊奘冉尊感到自己被羞辱，派“黄泉丑女”追赶，被伊奘诺尊击退，于是亲自去追。伊奘诺尊逃至“黄泉比良坂”时，用巨石堵截对方来路。二神互相对峙，说出“绝妻之誓”。伊奘冉尊便说“爱也吾夫君，言如此者，吾当缢杀汝所治国民日将千头。”伊奘诺尊不甘示弱，回答说：“爱也吾妹，言如此者，吾则当产日将千五百头。”又说：“自此莫过”，分隔阴阳两界，双方正式诀别。
* 学者阐释：日本武光诚认为，伊奘诺尊夫妇的生离死别，反映了古代日本人对死亡的观念。伊奘诺尊堵塞黄泉比良坂，代表生人世界与黄泉是对立的，不可能任意往来。另外，伊奘冉尊说“吾当缢杀汝所治国民日将千头”，以及伊奘诺尊说“吾则当产日将千五百头”，是要说明每天都有超过死者数量的新生命诞生，让人们明白“因为有死亡才能造就人类繁荣昌盛”的观念。
伊奘诺尊的修禊及继续产生诸神
伊奘诺尊返回地面后，认为自己“亲见泉国，此既不祥”，于是在筑柴日向进行一次“修禊”（袪除污秽的净化仪式）。在洗濯过程中，从他抛弃的衣物及身上的秽物，生成三位污秽之神，他们是八十枉津日神、神直日神、大直日神，另外又生海神、船神，以及三位“贵子”天照大神、月夜见尊、素盏呜尊等神灵。之后，伊奘诺尊安排天照大神管治“高天原”、月夜见尊“配日而知天事”，又命素盏命尊管治“海原国”，素盏命尊不从，遭到放逐。到此，伊奘诺尊功德圆满，《日本书纪》说他最后“神功既笔，灵运当迁。是以，构幽宫于淡路之洲，寂然长隐者矣。亦曰，伊奘诺尊，功既至矣。德亦大矣。于是，登天报命。留宅于日之少宫矣。”
※关于天照大神、月夜见尊、素盏呜尊三神的诞生的传说，在《日本书纪》里出现两次，一次是伊奘诺尊与伊奘冉尊所生（《日本书纪》又附有另一说法，是伊奘诺尊“左手持白铜镜”而化出天照大神、“右手持白铜镜”而化出月夜见尊、“回首顾眄之间”而化出素盏呜尊）。，另一则是伊奘诺尊这次修褉的时候所生。
* 学者阐释：日本学者武光诚指出，神话中伊奘诺尊生了污秽之神及天照大神等“贵子”，反映了世间上的万事万物，被认为存在着“天”与“地”的区别、“洁净之物”与“污秽之物”的区别、“尊”与“卑”的区别，这亦是日本人思想的基础，并与天皇皇室作为统治者的依据有关。