“国防部”先是不理，后又考虑不理似乎说不过去，于6月9日叫律师墨文藻给周其新草草回复了不痛不痒的几句话，对李敖所提的问题避而不答。
6月15日，李敖找出当局的有关政策，对“国防部”福利总处的回函，一一进行了反驳。
李敖代周其新写的反驳信发去后，一个多月不见回音。后经了解，台湾“国防部”已将此事交给总政治作战部查办。
8月11日，总政治作战部给周其新回函，告知请循法律办理。
按照1978年7月17日公布的“国防部”参谋本部组织法第八条规定，“国防部”福利总处是归总政治作战部管理的，此事应归他们处理。业主们向“国防部”如此详细地举出证据后，总政治作战部竟听信福利总处的一面之词，草草应付周其新等人的质问，显然是极其错误的。
7月22日，“国防部”福利总处叫律师墨文藻给水晶大厦送来一函，函中不但不认错，反而颠倒黑白，胡扯乱拉，并对周其新等人进行威胁。
7月23日，李敖给“国防部”部长高魁元去函，将“国防部”福利总处的函件进行了反驳，并从6个方面举证证实他们是如何欺压水晶大厦业主的。
8月24日，李敖再给“国防部”部长高魁元写信，向他指出：总政治作战部为福利总处主管机关，应依法受理人民诉愿及检举，还应根据来信内容查核是否属实，以明事情真相，再就是非、对错进行答复。而总政治作战部不但不对此事进行调查，反而叫民众用打官司的办法去办理，这样对待民众的诉求，是爱民吗？
李敖还在信中再次要求“国防部”对民众的诉求进行认真的调查，然后严惩福利总处中欺压百姓的不良分子。
此信发出去后，“国防部”与总政治作战部还是不理会。他们仍旧任其下属单位欺压百姓，受害百姓只有继续受害了。
此笔墨官司的最后的结局是：军事大衙门永远胜利，百姓永远失败。过去的唇舌、证据、文字成了鸡毛敲大钟，白费劲。枪杆子到底还是比笔杆子厉害。这一结局，正应验了一句俗语：秀才遇着兵，有理说不清。
1993年9月11日，李敖突然在报上看到一则消息，说“国防部”福利总处在水晶大厦的运货电梯因管理不善，钢缆突断，摔死了人，这是一起人为的责任事故。看到这则消息，李敖感慨万千，并想起5年前与这个军事大衙门的笔战，觉得应乘此机会，将他们在水晶大厦的丑事一一暴露出来，让人们看清口口声声要老百姓“敬军”、“爱军”的这个军事大衙门对人民是一副什么嘴脸。
9月22日，他找出5年前与“国防部”打笔仗的资料，写了2.6万字的《跟“国防部”打笔仗》一文，揭露“国防部”福利总处在18个方面欺压、勒索百姓，并在报刊上公开刊载出来。
过去，台湾民众因怕戴上不爱军、不敬军的大帽子，无人敢惹军事大衙门“国防部”，李敖不但不怕，而且还公开在报刊上揭“国防部”的丑，丢“国防部”的脸，为水晶大厦的所有受害人出了一口气。
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