考古学者在距今3000多年的台湾卑南遗址当中，曾经发现过3件陪葬用的人兽形玦。在全世界的考古发掘中，这种人兽形玦只有在台湾出现过。而在人兽形玦上面，正可以找到类似云豹的图腾(张岱屏 nd)。
台湾云豹第一次被列入科学文献的记载中是在1862年，是由第一个踏上台湾的西方国家官员史温侯(Robert Swinhoe，当时在英国驻打狗领事馆工作)所记载下来的。在那一年，史温侯于英国的《伦敦动物学会集刊(Proceedings of the Zoological Society of London，简写为PZS)》上，发表了〈福尔摩沙岛上的哺乳动物(On the Mammals of the Island of Formosa)〉这篇文章，里面提到了台湾猕猴、台湾黑熊、台湾石虎、台湾云豹等哺乳动物，这也是这些动物第一次见诸于正式科学文献的纪录(Hall 1999)。
然而，从1862年到现在的140几年来，虽然台湾的原住民陆续一直有人宣称看到云豹，却从来没有研究者真正看过台湾云豹的活体、甚至是活体照片，因此也无法确定原住民所看到的，就是台湾云豹(钟丽华 2004)。以台湾的动物园所豢养的云豹而言，目前有纪录可查的虽然有15只，但都不是台湾云豹，而是从别的国家进口的“苏门达腊亚种”或其他亚种(台北市立动物园 2004；台湾原图集邮世界 nd)。 云豹为台湾特有亚种。
目前台湾唯一能见到的台湾云豹，是收藏于国立台湾博物馆内的一只标本，这是日治时期所遗留下来的(国立台湾博物馆 2003；台湾原图集邮世界 nd)。而台湾最后一笔野外云豹的资料，则是出现在1983年。当时东海大学环境科学中心的研究员张万福，在一个原住民猎人的陷阱中发现了一只已死亡的幼豹(钟丽华 2004)。1987年2月，行政院农业委员会请美国猫科专家罗宾维兹博士亲临台湾的大武山察视。罗宾维兹的结论是台湾尚有几处环境尚属完整、而和泰国云豹出没地区之栖息环境相似的地方，有可能还存在着云豹(彭明敏文教基金会 1998)。
从2001年开始，为了对台湾云豹做更准确的纪录，屏东科技大学野生动物保育研究所和农委会特有生物保育研究中心，开始分别在南部的大武山和中部的山区，在600个以上的观察点装设了自动照相机，想要对台湾云豹进行观察记录。该计划延续了将近3年，却始终不见台湾云豹的踪影。学者认为，台湾云豹可能已经绝种，即便没有绝种，恐怕也难以繁衍下去了