shēng wù de jī yīn zǔ zhōng， tè bié shì gāo děng shēng wù de jī yīn zǔ zhōng hán yòu dà liàng de chóngfù xù liè 〔 14 〕， gēn jù chóngfù xù liè zài jī yīn zǔ zhōng de fēn bù xíng shì kě jiāng qí fēn wéi chuàn lián chóngfù xù liè hé sàn bù chóngfù xù liè。 qí zhōng， chuàn lián chóngfù xù liè shì yóu xiāng guān de chóngfù dān wèi shǒu wèi xiāng lián、 chéng chuàn pái liè 'ér chéng de。 mù qián fā xiàn de chuàn lián chóngfù xù liè zhù yào yòu liǎng lèi： yī lèi shì yóu gōng néng jī yīn zǔ chéng de ( rú rrna hé zǔ dàn bái jī yīn )； lìng yī lèi shì yóu wú gōng néng de xù liè zǔ chéng de。 gēn jù chóngfù xù liè de chóngfù dān wèi de cháng dù， kě jiāng chuàn lián chóngfù xù liè fēn wéi wèi xīng dna、 wēi wèi xīng dna、 xiǎo wèi xīng dna děng〔 3〕。 wēi wèi xīng dna yòu jiào jiǎn dān chóngfù xù liè， zhǐ de shì jī yīn zǔ zhōng yóu 1 ～ 6 gè hé gān suān zǔ chéng de jī běn dān wèi chóngfù duō cì gòu chéng de yī duàn dna， guǎng fàn fēn bù yú jī yīn zǔ de bù tóng wèi zhì， cháng dù yī bān zài 200bp yǐ xià。 yán jiū biǎo míng， wēi wèi xīng zài zhēn hé shēng wù de jī yīn zǔ zhōng de hán liàng fēi cháng fēng fù， ér qiě cháng cháng shì suí jī fēn bù yú hé dna zhōng〔 15， 38〕。 zài zhí wù zhōng tōng guò duì nǐ nán jiè〔 7〕、 yù mǐ〔 35〕、 shuǐ dào〔 11〕、 xiǎo mài〔 28， 32， 33〕 děng de yán jiū biǎo míng wēi wèi xīng zài zhí wù zhōng yě hěn fēng fù， jūn yún fēn bù yú zhěng gè zhí wù jī yīn zǔ zhōng， dàn bù tóng zhí wù zhōng wēi wèi xīng chū xiàn de pín shuài biàn huà shì fēi cháng dà de， rú zài zhù yào de nóng zuò wù zhōng liǎng zhǒng zuì pǔ biàn de 'èr hé gān suān chóngfù dān wèi (ac)n hé (ga)n zài shuǐ dào、 xiǎo mài、 yù mǐ、 yān cǎo zhōng de shù liàng fēn bù pín shuài shì bù tóng de。 zài xiǎo mài zhōng gū jì yòu 3000 gè (ac)n xù liè chóngfù hé yuē 6000 gè (ga)n xù liè chóngfù， liǎng gè chóngfù zhī jiān de jù lí píng jūn fēn bié wéi 704kb、 440kb〔 32， 33〕， ér zài shuǐ dào zhōng， (ac)n xù liè chóngfù yuē yòu 1000 gè zuǒ yòu， (ga)n chóngfù yuē yòu 2000 gè， chóngfù zhī jiān de píng jūn jù lí fēn bié wéi 450kb、 225kb〔 41〕。 lìng wài zài zhí wù zhōng yě fā xiàn yī xiē sān hé gān suān hé sì hé gān suān de chóngfù， qí zhōng zuì cháng jiàn de shì (aag)n、 (aat)n〔 15〕。 zài dān zǐ yè hé shuāng zǐ yè zhí wù zhōng ssr shù liàng hé fēn bù yě yòu chā yì， píng jūn fēn bié wéi 64.6kb hé 21.2kb zhōng yòu yī gè ssr。 yán jiū hái fā xiàn， dān hé gān suān jí 'èr hé gān suān chóngfù lèi xíng de ssr zhù yào wèi yú fēi biān mǎ qū， ér yòu bù fēn sān hé gān suān lèi xíng wèi yú biān mǎ qū。 lìng wài zài yè lǜ tǐ jī yīn zǔ zhōng， mù qián yě bào dào liǎo yī xiē wēi wèi xīng， yǐ a/t xù liè chóngfù wéi zhù〔 3〕。
yán jiū fā xiàn， wēi wèi xīng zhōng chóngfù dān wèi de shù mù cún zài gāo dù biàn yì， zhè xiē biàn yì biǎo xiàn wéi wēi wèi xīng shù mùdì zhěng bèi xìng biàn yì huò chóngfù dān wèi xù liè zhōng de xù liè yòu kě néng bù wán quán xiāng tóng， yīn 'ér zào chéng duō gè wèi diǎn de duō tài xìng。 rú guǒ néng gòu jiāng zhè xiē biàn yì jiē shì chū lái， jiù néng fā xiàn bù tóng de ssr zài bù tóng de zhǒng shèn zhì bù tóng gè tǐ jiān de duō tài xìng， jī yú zhè yī xiǎng fǎ， rén men fā zhǎn qǐ liǎo ssr biāo jì 。 ssr biāo jì yòu chēng wéi sequencetaggedmicrosatellitesite, jiǎn xiě wéi stms， shì mù qián zuì cháng yòng de wēi wèi xīng biāo jì zhī yī。 yóu yú jī yīn zǔ zhōng mǒu yī tè dìng de wēi wèi xīng de cè yì xù liè tōng cháng dōushì bǎo shǒu xìng jiào qiáng de dān yī xù liè， yīn 'ér kě yǐ jiāng wēi wèi xīng cè yì de dna piàn duàn kè lóng、 cè xù， rán hòu gēn jù wēi wèi xīng de cè yì xù liè jiù kě yǐ rén gōng hé chéng yǐn wù jìn xíng pcr kuò zēng， cóng 'ér jiāng dān gè wēi wèi xīng wèi diǎn kuò zēng chū lái。 yóu yú dān gè wēi wèi xīng wèi diǎn chóngfù dān yuán zài shù liàng shàng de biàn yì， gè tǐ de kuò zēng chǎn wù zài cháng dù shàng de biàn huà jiù chǎn shēng cháng dù de duō tài xìng， zhè yī duō tài xìng chēng wéi jiǎn dān xù liè chóngfù cháng dù duō tài xìng (sslp)， měi yī kuò zēng wèi diǎn jiù dài biǎo liǎo zhè yī wèi diǎn de yī duì děng wèi jī yīn。 yóu yú ssr chóngfù shù mù biàn huà hěn dà， suǒ yǐ ssr biāo jì néng jiē shì bǐ rflp gāo dé duō de duō tài xìng， zhè jiù shì ssr biāo jì de yuán lǐ。
yǔ qí tā fènzǐ biāo jì xiāng bǐ， ssr biāo jì jù yòu yǐ xià yōu diǎn： (1) shù liàng fēng fù， fù gài zhěng gè jī yīn zǔ， jiē shì de duō tài xìng gāo； (2) jù yòu duō děng wèi jī yīn de tè xìng， tí gōng de xìn xī liàng gāo； (3) yǐ mèng dé 'ěr fāng shì yí chuán， chéng gòng xiǎn xìng； (4) měi gè wèi diǎn yóu shè jì de yǐn wù shùn xù jué dìng， biàn yú bù tóng de shí yàn shì xiāng hù jiāo liú hé zuò kāi fā yǐn wù。 yīn 'ér mù qián gāi jì shù yǐ guǎng fàn yòng yú yí chuán tú pǔ de gòu jiàn〔 11， 12， 18， 19， 33〕、 mù biāo jī yīn de biāo dìng〔 8， 9， 21， 22， 26〕、 zhǐ wén tú〔 22〕 de huì zhì děng yán jiū zhōng。 dàn yìng kàn dào， ssr biāo jì de jiàn lì shǒu xiān yào duì wēi wèi xīng cè yì xù liè jìn xíng kè lóng、 cè xù、 rén gōng shè jì hé chéng yǐn wù yǐ jí biāo jì de dìng wèi、 zuò tú děng jī chǔ xìng yán jiū， yīn 'ér qí kāi fā fèi yòng xiāng dāng gāo， gè gè shí yàn shì bì xū jìn xíng hé zuò cái néng kāi fā gèng duō de biāo jì。 yóu yú ssr biāo jì jù yòu jiào dà de yìng yòng jià zhí， qiě zhǒng shǔ tè yì xìng jiào qiáng， mù qián zài yī xiē zhù yào de nóng zuò wù zhōng ssr biāo jì yán jiū dū jìn xíng liǎo hé zuò， gòng tóng jìn xíng stms yǐn wù de kāi fā。 |
|
|