2003年,董枝明等學者在命名吉大翼竜時將其歸於翼竜目的翼手竜亞目,但並未確定其所屬的科。來自中國和巴西的一群科學家2005年在《自然》雜志上發表的論文認為吉大翼竜是無齒翼竜的近親,可能與朝陽翼竜同屬,甚至同種。而中國地質科學院的呂君昌和季強2006年在韓國古生物學會雜志上發表的論文則認為吉大翼竜與朝陽翼竜可能屬於神竜翼竜超科,並且這兩者比始無齒翼竜和始神竜翼竜進化程度更高。英國萊斯特大學的大衛·昂溫(David Unwin)在2006年出版的《The Pterosaurs: From Deep Time》一書中,將吉大翼竜歸類到古神翼竜科,但沒有註明理由。2008年,呂君昌與大衛·昂溫等人認定吉大翼竜屬於神竜翼竜超科,與朝陽翼竜為近親,並將吉大翼竜和朝陽翼竜均歸類到新設立的朝陽翼竜科。
參考資料
董枝明,孫躍武,伍少遠, 遼西朝陽盆地早白堊世一新的無齒翼竜化石, 世界地質. 2003年3月, 22 (1): 第1-7頁.
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