信息安全国家重点实验室(State key laboratory of information security)筹建于1989年，1991年通过国家验收并正式对外开放。实验室由中国科学院主管，依托于中国科学院软件研究所和中国科学院研究生院。
实验室的总体定位是：瞄准国际信息安全学科发展前沿，密切结合国家信息安全战略需求，进行信息安全前沿性和前瞻性科学问题创新性研究和自主信息安全关键技术研发。
实验室的总体目标是：为国家信息安全保障体系建设提供理论指导和科学依据；对前沿性和前瞻性信息安全科学问题进行创新性研究，以促进和推动信息安全学科的发展；研发具有自主知识产权的关键安全技术和系统，以满足国家和行业部门的需求；为国家培养高水平的信息安全专业人才。
实验室成立以来，在科学研究、人才培养、学术交流、科研成果转化等方面取得了丰硕成果。已发表学术论文1500多篇，出版著作（译著）70多部，承担国家级和省部级项目300多项，科研成果获国家级、省部级奖励20项，其中获国家科技进步一等奖1项，国家科技进步二等奖4项，国家自然科学三等奖2项，省部级一等奖6项。实验室现有固定人员53人，流动人员（包括高级访问学者、博士后、博士生、硕士生等）193余人。实验室拥有4200多平方米的办公用房，已建成一流的网络安全实验环境。