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動物界最高等的一門動物。其共同特徵是在其個體發育全過程或某一時期具有脊索、背神經管和鰓裂；包括尾索動物、頭索動物和脊椎動物。除去以上主要特徵外,脊索動物還具有一些次要的特徵：密閉式的循環係統(尾索動物除外),心髒如存在,總是位於消化管的腹面；肛後尾,即位於肛門後方的尾,存在於生活史的某一階段或終生存在；具有胚層形成的內骨胳。至於後口、兩側對稱、三胚層、真體腔和分節性等特徵則是某些無脊椎動物也具有的。
脊索動物門定名於1874年,是由赫剋爾(ernst haeckel)根據俄國胚胎學家柯伐列夫斯基(А.О.Ковалевский)的研究,把海鞘、文昌魚等動物和脊椎動物合併在一起而成立了這一新門。脊索動物門包括現代生存的4萬多種動物,分為三個亞門：尾索動物亞門、頭索動物亞門和脊椎動物亞門。
脊索動物門（phylum chordata）是物種豐富多樣的大門。由於這個門包含了脊椎動物，所以人們對它進行了廣泛的研究。其中沒有脊椎的脊索動物在進化中有很重要的意義。有時它們也被稱為原索動物。這個名稱以前還包括半索動物在內。脊索動物大約有45000個種類，分佈在海洋、淡水、介於淡水和鹹水之間的水體和陸生環境。有些類群進化為具有飛翔的能力。
現存6萬餘種，占全世界動物種類的5%左右。包括七鰓鰻、魚、蛙、螈、蛇、蜥、龜、鰐、鳥、獸等脊椎動物，也包括一些數量不多、缺乏椎骨而衹有脊索的海産動物，如各種海鞘和文昌魚等。
背部具有棒形脊索，本門動物的命名即由此而來。 |
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（1）脊索（notochord）
位於消化道和神經管之間的一條棒狀結構，具有支持功能。所有脊索動物的胚胎期均具有脊索，但在以後的生活中或終生保留，或退化並被脊柱（vertebral column）代替。
脊索來源於胚胎期的原腸背壁，經加厚、分化、外突，最後脫離原腸而成脊索。脊索由富含液泡的脊索細胞組成，外面圍有脊索細胞所分泌而形成的結締組織性質的脊索鞘（notochordal sheath）。脊索鞘常包括內外兩層，分別為纖維組織鞘（fibrous sheath）和彈性組織鞘（elastic sheath）。充滿液泡的脊索細胞由於産生膨壓，使整條脊索既具彈性，又有硬度， 從而起到骨骼的基本作用。
低等脊索動物中，脊索終生存在或僅見於幼體時期。高等脊索動物衹在胚胎期間出現脊索，發育完全時即被分節的骨質脊柱（vertebral column）所取代。組成脊索或脊柱等內骨骼（endoskeleton）的細胞，都能隨同動物體發育而不斷生長。而無脊椎動物則缺乏脊索或脊柱等內骨骼，通常僅身體表面被有幾丁質等外骨骼（exoskeleton）。
脊索的出現在動物演化史上具有重要意義。表現在：
①脊索（以及脊柱）構成支撐軀體的主梁，是體重的受力者，也是內臟器官得到有力的支持和保護。
②運動肌肉獲得堅強的支點，在運動時不致由於肌肉的收縮而使軀體縮短或變形，因而有可能嚮“大型化”發展。同時，脊索的中軸支撐作用也能使動物體更有效地完成定嚮運動，對於主動捕食及逃避敵害都更為準確、迅速。
③脊椎動物頭骨的形成、頜的出現以及椎管對中樞神經的保護，都是在此基礎上進一步完善化的發展。
（2）背神經管（dorsal tubular nerve cord）
位於脊索背面中空管狀的中樞神經係統。脊椎動物神經管前端膨大成腦，腦後部分形成脊髓。
由胚體背中部的外胚層下陷捲褶所形成。背神經管在高等種類中前、後分化為腦和脊髓。神經管腔（neurocoele）在腦內形成腦室（cerebral ventricle），在脊髓中成為中央管（centralcanal）。無脊椎動物神經係統的中樞部分為一條實性的腹神經索（ventral nerve cord），位於消化道的腹面。
（3）咽鰓裂（gill slits）
咽部兩側一係列成對的裂縫，直接或間接與外界相通。低等脊索動物及魚類的鰓裂終生存在，其他脊椎動物僅在胚胎期有鰓裂。
低等脊索動物在消化道前端的咽部兩側有一係列左右成對排列、數目不等的裂孔，直接開口於體表或以一個共同的開口間接地與外界相通，這些裂孔就是咽鰓裂。低等水棲脊索動物的鰓裂終生存在並附生着布滿血管的鰓，作為呼吸器官，陸棲高等脊索動物僅在胚胎期或幼體期（如兩棲綱的蝌蚪）具有鰓裂，隨同發育成長最終完全消失。無脊椎動物的鰓不位於咽部，用作呼吸的器官有軟體動物的櫛鰓以及節肢動物的肢鰓、尾鰓、氣管等。
（4）肛後尾（post-anal tail）
尾在肛門後方。肛後尾在所有的脊索動物中出現，至少在胚胎期（如人類）出現。
以上的前3個特徵是脊索動物的主要3大特徵，此外的肛後尾及閉管式循環係統（尾索動物除外）；心髒位於消化道腹面；胚胎期原腸胚的發育類型為原口；分節的肌節，附着在不分節的軀幹上等特徵為脊索動物的次要特徵。
無脊椎動物的肛孔常開口在軀幹部的末端。
（5）脊索動物的心髒及主動脈
位於消化道的腹面，循環係統為閉管式。無脊椎動物的心髒及主動脈在消化道的背面，循環係統大多為開管式。
在上述特徵中，具有脊索、背神經管和咽鰓裂是區別脊索動物和無脊椎動物最主要的3個基本特徵。此外，脊索動物還有一些性狀同樣也見於高等無脊椎動物的，例如三胚層、後口、存在次級體腔、兩側對稱的體製、身體和某些器官的分節現象等。這些共同點表明脊索動物是由無脊椎動物進化而來的。 |
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現存的脊索動物約有41000多種，分為2大類群3個亞門，其中的尾索動物和頭索動物兩個亞門合稱為原索動物（protochordata）：即無真正的頭和腦，又稱無頭類（acrania）。
（1）尾索動物亞門（urochordata）
幼體具上述3大特徵，但脊索在尾部。變態後脊索消失，背神經管退化成神經節，鰓裂仍存在。成體具被囊（tunic），大多營固着生活。
尾索動物和頭索動物兩個亞門是脊索動物中最低級的類群，總稱為原索動物（protochorda-ta）。身體包在膠質（gelatinous）或近似植物纖維素成分的被囊中，至少在幼體時期尾部具有脊索及神經管，所以稱為尾索動物或被囊動物（tunicate）。全世界約有1370多種，常見種類有柄海鞘（styela clava）、海樽（ascida）、玻璃海鞘（ciona）、菊花海鞘（botryllus）等，分佈遍及世界各地的海洋。體呈袋形或桶狀，包括單體或群體兩個類型，絶大多數無尾種類衹在幼體時期自由生活，成體於淺海潮間帶營底棲固着生活，少數終生有尾種類在洋面上營漂浮式的自由遊泳生活。體表有入水孔（incurrent siphon）和出水孔（excurrent siphon），咽壁有數量不等的鰓裂，咽外圍有寬大的圍鰓腔（peribranchial cavity），與出水管孔相通。一般為雌雄同體（hermaphroditism），異體受精。由於卵和精子並不同時成熟，所以避免了自體受精。營有性生殖，也營無性的出芽生殖，樽海鞘的生活史中甚至還有復雜的世代交替現象。除個別種類外，受精卵都先 發育成善於遊泳的蝌蚪狀幼體，再行變態發育。
早在2千多年前，尾索動物就已經被記載和描述，曾先後隸屬於無脊椎動物中的蠕蟲類、擬軟體動物、苔蘚動物或軟體動物，直到1866年俄國學者柯瓦列夫斯基仔細地研究了海鞘的胚胎發育及其變態後，纔正式判定其正確的分類地位，置於脊索動物門。
一、代表動物--柄海鞘（styela clava）
海鞘是尾索動物亞門中最主要的類群，約占全部種數的90％以上。柄海鞘是海鞘類中的優勢種，經常與盤管蟲（hydroides）、藤壺（balanus）及苔蘚蟲（bugula）等附着在一起，固着在碼頭、船塢、船體，以及海水養殖的海帶筏和扇貝籠上，被作為沿海污損生物的重要指標種。柄海鞘的身體構造及變態過程在本月動物中具有一定的代表性，現以此為例簡述其主要特徵。
（一）外形和生活方式
柄海鞘的成體呈長橢圓形，基部以柄附生在海底或被海水淹沒的物體上，另一端有2個相距不遠的孔：頂端的一個是入水孔，孔內通消化管而中間有一片篩狀的緣膜，其作用是濾去粗大的物體，衹容許水流和微小食物進入消化道；位置略低的一個是出水孔（圖14-3）。從胚胎發生和幼體變態的過程來看，兩孔之間是柄海鞘的背部，對應的一側為腹部。一般情況下，水流從入水孔進入而由出水孔排出，當受驚擾或刺激時，則可引起體壁驟然收縮，體內積貯的水分別從2個孔中似乳汁般同時噴射而出，故在山東省沿海一帶俗稱海奶子；刺激緩解後，身體又逐漸恢復原狀。它們除了可以成簇密集生活外，還能附着在同種的其它個體上，同時本身又可以被別的個體所附着，呈現壘疊的聚生現象。
（二）內部構造
1.體壁：柄海鞘的體壁即是包藏內部器官的外套膜（mantle），外套膜除了表面一層外胚層的上皮細胞外，還參雜着來源於中胚層的肌肉纖維，以支配身體及出、入水孔的伸縮和開關。體壁能分泌一種化學成分類似植物纖維素的被囊素（tunicin），並由此形成包圍在動物體外的被囊，這就是被囊動物名稱的由來。在整個動物界中，體壁能分泌被囊素的動物，至今僅發現於尾索動物和少數原生動物。外套膜在入水孔和出水孔的邊緣處與被囊匯合，匯合處有環形括約肌控製管孔的啓閉。內部器官中衹有咽的上緣及腹面的一部分與外套膜愈合。柄海鞘的被囊表面通常不易被其它動物所附着，但是同種個體卻能重疊附生，這對種群的繁衍顯然是有積極意義的。
2.消化和呼吸係統：入水孔的底部有口，通過四周長有觸手的緣膜就是寬大的咽，咽幾乎占據了身體的大半部（3/4），咽壁被許多細小的鰓裂所貫穿。從口進入咽內的水流經過鰓裂，到達圍着咽外的圍鰓腔中，然後 經出水孔排出。圍鰓腔是由身體表面陷入內部所形成的空腔，因其不斷擴大，從而將身體前部原有的體腔逐漸擠小，最終在咽部完全消失。由於鰓裂的間隔裏分佈着豐富的毛細血管，因此當水流攜帶着食物微粒通過鰓裂時就能進行氣體交換，完成呼吸作用。咽腔的內壁生有纖毛，其背、腹側的中央各有一溝狀結構，分別稱為背板（dorsal lamina或咽上溝epipharyngeal groove）和內柱（endostyle），溝內有腺細胞和纖毛細胞；背板和內柱上下相對，在咽的前端以圍咽溝（peripharyngeal groove）相連，腺細胞能分泌粘液，使沉入內柱的食物粘聚成團，由溝內的纖毛擺動，將食物團從內柱推嚮前行，經圍咽溝沿背板往後導入食道、胃及腸進行消化。腸開口於圍鰓腔，不能消化的殘渣通過圍鰓腔，隨水流經出水孔排出體外。
3.循環方式和排泄器官：心髒位於身體腹面靠近胃部的圍心腔（pericardial cavity）內，藉圍心膜的伸縮而搏動。心髒兩端各發出一條血管，前端一條為鰓血管，沿咽腹發出分支到鰓裂間的咽壁上；後端一條稱腸血管，分支到各內臟器官並註血進入器官組織的血竇之間，所以是開管式的血液循環。柄海鞘具有特殊的可逆式血液循環流嚮，即心髒收縮有周期性間歇，當它的前端連續搏動時，血液不斷地由鰓血管壓出至鰓部，接着心髒有短暫的停歇，容納鰓部的血液流回心髒，然後於其後端開始搏動，將血液註入腸血管而分佈到內臟器官的組織間。因此，柄海鞘的血管既無動脈和靜脈之分，血液也無固定的單嚮流動方向，這種獨特的血液循環方式在動物界中是絶無僅有的。
柄海鞘無專門的排泄器官，僅在腸附近有一堆具排泄機能的細胞，稱為小腎囊（renal vesicles），其中常含尿酸結晶。
4.神經：柄海鞘的成體營固着生活，神經係統和感覺器官均甚退化，中樞神經衹是一個沒有內腔的神經節（nervus ganglion），圓而堅硬，狀如小瘤，位於入水孔和出水孔之間的外套膜壁內，由此分出若幹神經分支到身體各部，神經節旁有一無色透明而略為膨大的神經腺（neural gland，相當高等動物的腦下腺hypophy-sis）。無專門的感覺器官，僅於入水管孔、出水管孔的緣膜和外套膜上有少量散在的感覺細胞。
5.生殖係統：雌雄同體，生殖腺位於腸環間和外套膜內壁上。精巢大，呈分支狀，為乳白色顆粒狀小塊；卵巢長管狀，呈淡黃色，內含許多圓形的卵細胞；兩者緊貼重疊，分別以單根生殖導管（gonoduct）將成熟的性細胞輸入圍鰓腔，然後經出水管孔排至體外，或在圍鰓腔內與另一海鞘的生殖細胞相遇受精。
（三）幼體及變態
柄海鞘成體的形態結構與典型的脊索動物有很大差異。然而，它的幼體外形酷似蝌蚪並具有脊索動物3個主要特徵。幼體長約0.5mm，尾內有發達的脊索，脊索背方有中空的背神經管，神經管的前端甚至還膨大成腦泡（cerebral vesicle），內含眼點和平衡器官等；消化道前段分化成咽，有少量成對的鰓裂；身體腹側有心髒。
幼體經過幾小時的自由生活後，就用身體前端的附着突起（adhesivepapillae）粘着在 其它物體上，開始其變態。在變態過程中，海鞘幼體的尾連同內部的脊索和尾肌逐漸萎縮，並被吸收而消失，神經管及感覺器官也退化而殘存為一個神經節。與此相反，咽部卻大為擴張，鰓裂數急劇增多，同時形成圍繞咽部的圍鰓腔；附着突起也為海鞘的柄所替代。附着突起背面因生長迅速，把口孔的位置推移到另一端（背部），於是造成內部器官的位置也隨之轉動了90°～180°的角度。最後，由體壁分泌被囊素構成保護身體的被囊，使它從自由生活的幼體變為營固着生活的柄海鞘。柄海鞘經過變態，失去了一些重要的構造，形體變得更為簡單，這種變態稱為逆行變態（retrogressive metamorphosis）。
二、尾索動物分類
本亞門是脊索動物中最低等的類群，遍布世界各個海洋，約1370多種，分屬於3綱，我國已知有14種左右。
（一）尾海鞘綱（appendiculariae）本綱是尾索動物中的原始類型，共1目3科60餘種。體長數毫米至20mm，代表動物為住囊蟲（oikopleura）和巨尾蟲（megalocercus huxleyi）等。尾海鞘綱與本亞門中其他2綱的主要區別是：體外無被囊，衹有兩個直接開口體外的鰓裂而缺乏國鰓腔，終生保持着帶有長尾的幼體狀態（neotonous），大多在沿岸淺海中營自由遊泳生活。生長發育過程中無逆行變態，故又名幼形綱（larva-cea）。住囊蟲包藏在由皮膚分泌的膠質住囊（gelatinous'house'）內，住囊有入水孔和出水孔，住囊蟲在囊中藉助內有脊索和神經索的尾巴擺動進水，並使囊中的水由出水孔排出，推動動物體前進，同時通過蟲體口外特有的網篩（filter），從流水中濾取微 小的浮遊生物作為食物。每隔數小時，住囊的出、入水孔就將被堵塞。此時住囊蟲即激烈揮動長尾，從特殊的應急出口（或稱小室孔道 escape hatch）破囊衝出至海中，並在很短的時間裏再形成新的住囊。
我國至今尚未發現本綱動物。
（二）海鞘綱（ascidiacea）種類繁多，約有1250種，包括單體和群體2種類型，附着於水下物體或營水底固定生活。單體型種類的最大體長可達200mm，群體的全長可超過0.5m以上。群體型種類的許多個體都以柄相連，並被包圍在一個共同的被囊內，但分別以各自的入水孔進水，有共同的排水口，如群體海鞘（diplosoma）。
廣布於我國的海鞘綱動物有米氏小葉鞘（leptoclinum mitsukurii）、星座美洲海鞘（amarou-cium constellatum）、長紋海鞘（ascidia longistriata）、玻璃海鞘（ciona intestinalis）、3種菊海鞘（botryllus ssp.）、瘤海鞘（styela canops）、乳突皮海鞘（molgula manhattensis）、龜甲海鞘（chely-osoma）、西門登擬菊海鞘（botrylloides simodensis）等。乳突皮海鞘和柄海鞘是連雲港以北黃、渤海沿岸污損生物中的優勢種，瘤海鞘大量出現在香港、西沙永興島和琛航島等南海海域內。
（三）樽海鞘綱（thaliacea）本綱動物大多是營自由遊泳生活的漂浮型海鞘，體呈桶形或樽形，咽壁有2個或更多的鰓裂。成體無尾，入水孔和出水孔分別位於身體的前後端。被囊薄而透明，囊外有環狀排列的肌肉帶，肌肉帶自前往後依次收縮時，流進入水孔的水流即可從體內通過出水孔排出，以此推動樽海鞘前進，並在此過程中完成攝食和呼吸作用。生活史較復雜，繁殖方式是有性與無性的世代交替。樽海鞘綱約有65種，代表動物有樽海鞘（doliolum deuticula-tum），我國廈門沿海曾發現過小海樽（dolioletta natilnalis）。磷海鞘（pyrosoma atlanticum）為群體型種類，身體總長度可達200mm～600mm，因其口孔內緣有磷光器，漂浮遊泳時能發出閃爍的磷光而得名，別名火體蟲。
三、尾索動物的演化
尾索動物是最低等的脊索動物，與高等脊索動物存在着演化上的親緣關係，兩者可能都是從類似海鞘幼蟲型營自由生活的共同祖先--原始無頭類動物演化而來。這類原始無頭類動物不但將幼體時期的尾和自由遊泳的生活方式保留到成體，甚至還消失了生活史中營固着生活的階段，並通過幼態滯留及幼體性成熟途徑發展為頭索動物和脊椎動物。尾索動物是在進化過程中適應特殊生活方式的一個退化分支，除保留濾食的咽及營呼吸作用的咽鰓裂外，大多數種類已在變態中失去所有的進步特徵，並嚮固着生活的方向發展
（2）頭索動物亞門（cephalochordata）
上述3大特徵終生存在。脊索縱貫全身，並嚮前延伸至背神經管前端。
頭索動物是一類終生具有發達脊索、背神經管和咽鰓裂等特徵的無頭魚形脊索動物。包括頭索綱（cephalochorda，又名狹心綱leptocardii）、鰓口科（branchiostomidae），約30種，分隸於文昌魚和偏文昌魚（asymmetron）2個屬。頭索動物分佈很廣，遍及熱帶和溫帶的淺海海域，其中尤以北緯48°至南緯40°之間的沿海地區數量較多。
頭索動物的脊索不但終生保留，且延伸至背神經管的前方，故稱頭索動物。又因本亞門動物都缺乏真正的頭和腦，所以又稱無頭類。我國廈門、青島等地所産的文昌魚（ branchiostomabelcheri），可作為頭索動物的代表。
一、代表動物--白氏文昌魚（ branchiostoma belcheri）
（一）外形和生活方式
文昌魚的體形略似小魚，無明顯的頭部，左右側扁，半透明，可隱約見到皮下的肌節（myomere）和腹側塊狀的生殖腺；身體兩端尖出，故有雙尖魚（amphioxus）之稱，又因其尾形很像矛頭而名海矛。一般體長約50mm，但産於美國的加州文昌魚（branchiostomacaliforniense）可超過100mm，是該屬中已知個體最大的一種。前端的腹面為一漏鬥狀的口笠（oral hood），口笠內為前庭（vestibule），內壁有輪器（wheel organ），由前庭引嚮位於一環形緣膜（velum）中央的口。口笠和緣膜的周圍分別環生觸須（cirri）及緣膜觸手（velar tentacle），具有保護和過濾作用，可阻擋粗砂等物隨水流進入口中。整個背面沿中綫有一條低矮的背鰭（dorsalfin），往後與高而繞尾的尾鰭（caudal fin）相連。此外在肛門之前還有肛前鰭（preanal fin）。無偶鰭，衹在身體前部的腹面兩側各有一條由皮膚下垂形成的縱褶，稱為腹褶（metapleura fold）。腹褶和肛前鰭的交界處有一腹孔（atripore），是咽鰓裂排水的總出口，故又名圍鰓腔孔。
文昌魚喜棲淺海水質清澈的沙灘上，平時很少活動，常把身體半埋於沙中，前端露出沙外，或者左側貼臥沙面，藉水流攜帶矽藻等浮遊生物進入口內。夜間較為活躍，憑藉體側肌節的交錯收縮，在海水中作短暫的遊泳。壽命約2年8個月左右。5～7月為生殖季節，一生中可繁殖3次，其中以最後一次産卵最多。福建沿海海區曾是我國文昌魚生息繁衍的理想場所。1932-1956年，文昌魚在同安縣一地的捕撈區面積約有22km2，每升沙樣中文昌魚的數量達357條，當時因年産量約57噸而高居世界首位。1956年，由於廈門高（崎）集（美）海堤建成後，海況（切斷了環島的海流、沙地面積大幅度減少、????度降低、水流減緩、淤泥沉積等）發生很大變化，再加上圍海造田和亂捕濫撈等原因，嚴重地破壞了文昌魚的生態環境，因而造成數量急劇下降的惡果，年産量減少了40％。1970年，當地的收購量甚至降低到衹有1t左右。1986年，文昌魚在這一海域的分佈區已縮小到0.5km2，而每l沙樣中的數量進一步減少到3條，使原來名聞遐邇的文昌魚産地，在20世紀半個世紀內變得完全失去了水産捕撈價值。
（二）內部構造特徵
1.皮膚：皮膚薄而半透明，由單層柱形細胞的表皮和凍膠狀結締組織的真皮兩部分構成，表皮外覆有一層角皮層（cuticle）。表皮外在幼體期生有纖毛，成長後則消失殆盡。
2.骨骼：文昌魚尚未形成骨質的骨骼，主要是以縱貫全身的脊索作為支持動物體的中軸支架。脊索外圍有脊索鞘膜，並與背神經管的外膜、肌節之間的肌隔、皮下結締組織等連續。脊索細胞呈扁盤狀，其超顯微結構與雙殼類軟體動物的肌細胞比較相似，收縮時可增加脊索的硬度。此外，在口笠觸須、緣膜觸手、輪器內部也都有角質物支持，奇鰭和鰓裂的鰭條（fin rays）及鰓條（gill bar）由結締組織支持。
3.肌肉：文昌魚背部的肌肉厚實而腹部比較單薄，與無脊椎動物周身體壁厚薄均勻的情況不同。全身主要的肌肉是60多對按節排列於體側的"v"字形肌節（myomere），尖端朝前，肌節間被結締組織的肌隔（myocomma）所分開。兩側的肌節互不對稱，便於文昌魚在水平方向作彎麯運動。此外，還有分佈在圍鰓腔腹面的橫肌和口緣膜上的括約肌等，控製圍鰓腔的排水及口孔的大小。
4.消化和呼吸器官：文昌魚靠輪器和咽部纖毛的擺動，使帶有食物微粒的水流經口入咽，食物被濾下留在咽內，而水則通過咽壁的鰓裂至圍鰓腔，然後由腹孔排出體外。作為收集食物和呼吸場所的咽部極度擴大，幾乎占據身體全長的1/2，咽腔內的構造與尾索動物相似，也具有內柱、咽上溝和圍咽溝等。文昌魚幼體的鰓裂直接開口於體表，後來形成圍鰓腔，以腹孔作為咽部鰓裂的總出水口。
咽內的食物微粒被內柱細胞的分泌物粘結成團，再由纖毛運動使它從後嚮前流動，經圍咽溝轉到咽上溝，往後推送進入腸內。腸為一直管，嚮前伸出一個盲囊，突入咽的右側，稱為肝盲囊（hepatic diverticulum），能分泌消化液，與脊椎動物的肝髒為同源器官。食物團中的小微粒可進入肝盲囊，被肝盲囊細胞所吞噬，營細胞內消化，大微粒在腸內分解成小微粒後，也轉到肝盲囊中進行細胞內消化，未消化的物質由肝盲囊重返腸中，在後腸部進行消化和吸收。腸的末端開口於身體左側的肛門。
咽腔是文昌魚完成呼吸作用的部位。咽壁兩側有60多對鰓裂，彼此以鰓條分開，鰓裂內壁布有纖毛上皮細胞和血管。水流進入口和咽時，藉纖毛上皮細胞的纖毛運動，通過鰓裂，並使之與血管內的血液進行氣體交換，最後，水再由圍鰓腔經腹孔排出體外。有人認為文昌魚纖薄的皮膚也具有直接從水中攝取氧氣的能力。
5.血液循環文昌魚循環係統屬於閉管式，即血液完全在血管內流動，這種情形與脊椎動物基本相同。無心髒，但是具搏動能力的腹大動脈（ventral aorta），因而被稱為狹心動物。由腹大動脈往兩側分出許多成對的鰓動脈（branchial arteries）進入鰓隔，鰓動脈不再分為毛細血管，它在完成氣體交換的呼吸作用後，於鰓裂背部匯入2條背大動脈根。背大動脈根內含多氧血，往前流嚮身體前端，嚮後則由左、右背大動脈根合成背大動脈（dorsal aorta），再由此分出血管到身體各部。血液無色，也沒有血細胞和呼吸色素，動脈中的血液通過組織間隙進入靜脈。從身體前端返回的血液通過體壁靜脈（parietal vein）註入一對前主靜脈（anterior cardinal vein）；尾的腹面有一條尾靜脈（caudal vein），收集一部分身體後部回來的血液，進入腸下靜脈（subintestinal vein），大部分血液則流進2條後主靜脈（posterior cardinal vein）。左、右前主靜脈和兩條後主靜脈的血液全部匯流至一對橫形的總主靜脈（common cardinal vein），或稱居維葉氏管（ducts cuvieri）。左、右總主靜脈會合處為靜脈竇（sinus venosus），然後通入腹大動脈。從腸壁返回的血液由毛細血管網集合成腸下靜脈，尾靜脈的部分血液也註入其中；腸下靜脈前行至肝盲囊處血管又形成毛細管網，由於這條靜脈的兩端在肝盲囊區都形成毛細血管，因此稱作肝門靜脈（hepatic portal vein）。由肝門靜脈的毛細血管再一次合成肝靜脈（hepatic vein）並將血液匯入靜脈竇內。
（3）脊椎動物（vertebrates）
屬於脊椎動物亞門，脊索或多或少被脊柱所代替，腦和感覺器官集中於前端，形成明顯頭部，稱為有頭類（craniata）。分為以下幾綱：
（1）圓口綱（cyclostomata）：無頜，又稱無頜類（agnatha）；無成對附肢。脊索終生存在，並出現雛形脊椎骨。
（2）魚綱（pisces）：又分為軟骨魚亞綱（chondrichthyes）和硬骨魚亞綱（osteichthyes） 前者出現上下頜，體被盾鱗，出現成對的鰭，鰓裂直接開口於體外；後者骨骼一般為硬骨，體被硬鱗、圓鱗或櫛鱗，鰓裂不直接開口於體表。
（3）兩棲綱（amphibia）：由水上陸的過渡種類，幼體魚形，以鰓呼吸，成體出現5指（趾）型四肢，皮膚裸露，以肺和皮膚呼吸。與其他更高等脊椎動物共稱為四足類（tetrapoda）。
（4）爬行綱（reptilia）：完全陸生。皮膚乾燥，被以角質鱗、角質骨片或骨板。肺呼吸。胚胎發育中出現羊膜，與鳥類、哺乳類共稱為羊膜類（amniotes）。其他各綱脊椎動物稱為無羊膜動物（anomniotes）。
（5）鳥綱（aves）：全身被羽，前肢變為翼，適應空中飛翔生活。血液循環為完全雙循環，恆溫，卵生。與哺乳類共稱為恆溫動物（endotherm）。其他脊椎動物均為變溫動物（ectotherm）。
（6）哺乳綱（mammalia）：體外被毛，恆溫，胎生（單孔類除外），哺乳（具乳腺）。 |
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（1）脊索動物與無脊椎動物的區別與聯繫
①脊索：脊索動物具有縱貫背部的脊索，後被脊柱所代替；無脊椎動物無脊索或脊柱。
②中樞神經：脊索動物中空的神經中樞位於背部；無脊椎動物中樞神經呈索狀位於身體腹面。
③鰓裂：脊索動物生活史的全部或部分時期具有鰓裂；無脊椎動物不具鰓裂。
④心髒位置：脊索動物心髒位於消化道腹面；無脊椎動物心髒位於消化道背面。
⑤生物化學方面：脊索動物參與肌肉收縮能量代謝的非蛋白質含氮浸出物是磷酸肌酸；無脊椎動物的是磷酸精氨酸。
脊索動物除上述特徵外，其一些結構也見於一些無脊椎動物中，如後口、三胚層、兩側對稱、真體腔、分節現象、閉管式血液循環等。兩者的結構比較見。
（2）脊索動物的起源
脊索動物無疑是由無脊椎動物起源的。而其中的棘皮動物和半索動物與脊索動物的親緣關係較近的觀點為大多數人所接受。
經推測，脊索動物的祖先可能類似於尾索動物的幼體，它嚮兩個方向發展，一是經過變態，成體為固者生活，具鰓裂作為取食和呼吸器官；另一個方向是幼體期延長並適應新的生活環境，不再變態，産生生殖腺並進行繁殖（即幼體性成熟），進而發展出新的一類動物，即具有脊索、背神經管和鰓裂的自由運動的脊索動物。
（3）脊索的出現在動物演化史上的意義
脊索的出現是動物演化史中的重大事件，使動物體的支持、保護和運動的功能獲得“質”的飛躍。這一先驅結構在脊椎動物達到更為完善的發展，從而成為在動物界中占統治地位的一個類群。
脊索（以及脊柱）構成支撐軀體的主梁，是體重的受力者，使內臟器官得到有力的支持和保護，運動肌肉獲得堅強的支點，在運動時不致由於肌肉的收縮而使軀體縮短或變形，因而有可能嚮“大型化”發展。脊索的中軸支撐作用也使動物體更有效地完成定嚮運動，對於主動捕食及逃避敵害都更為準確、迅捷。脊椎動物頭骨的形成、頜的出現以及椎管對中樞神經的保護，都是在此基礎上進一步完善化的發展。 |
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| 脊索動物門(Chordata) 消化道和背神經管之間有一條導源於中胚層的縱行脊索或脊柱的動物。現存6萬餘種，占全世界動物種類的5%左右。包括七鰓鰻、魚、蛙、螈、蛇、蜥、龜、鰐、鳥、獸等脊椎動物，也包括一些數量不多、缺乏椎骨而衹有脊索的海産動物，如各種海鞘和文昌魚等。 背部具有棒形脊索，本門動物的命名即由此而來。 尾索動物亞門(Urochoradata)是一類小型的海産無椎骨脊索動物，共計1000多種，因其終生或幼體的尾部具有脊索而得名。常見種類有柄海鞘和玻璃海鞘等。 頭索動物亞門(Cephalochordata)是分佈在海帶和溫帶的海生魚形脊索動物，全世界約有30種，代表動物為文昌魚(Branchiostoma belcheri)。 脊椎動物亞門(Vertbrata)是脊索動物中最主要的一個類群，包括圓口綱、軟骨魚綱、硬骨魚綱、兩棲綱、爬行綱、鳥綱、哺乳綱等7大類動物。 |
脊索動物門（化石） Chordates (fossil) |
jisuo dongwu men(huashi)
脊索動物門（化石）
脊索動物曾包括 4個亞門，即半索動物亞門、尾索動物亞門、頭索動物亞門和脊椎動物亞門(Vertebrata)。脊索動物化石中最重要而引人註目的首推脊椎動物化石。其次是半索動物亞門的筆石綱，在寒武紀至早石炭世是很重要的化石門類之一，廣泛分佈於世界各地。近年由於已單獨建立半索動物門，隨之筆石化石也被排出脊索動物化石之外。
頭索動物長期來未發現化石，1981年報道在南非二疊係中發現了頭索動物化石。
尾索動物化石迄今衹有少數報道。B.派爾曾將瑞士漸新世頁岩中發現的一些印痕解釋為海鞘類，但至今未被生物界及古生物界所承認。近年在中國南方早寒武世黑色頁岩中亦發現一些微小痕跡，被認為是尾索動物亞門幼形綱動物的化石。但由於年代太久遠(距今6億年左右)、個體太小（衹有8～12微米,約為0.1毫米，小於某些現生尾索動物的精子）和生物結構不清楚，未被生物學界和古生物學界承認。
其他如布爾吉斯頁岩中有可疑的脊椎動物化石 Pi-kaia等。
1967年R.P.S.傑弗裏斯再次提出原屬棘皮動物門海扁果亞門的海樁綱(Stylophora)應屬脊索動物中一個獨立的鈣索動物亞門 (Calcichordata)。他認為所有的鈣索動物都有一個大而重的、覆有碳酸鈣骨板的頭和一個尾。在化石上發現了一些可以與脊索動物的咽、鰓裂、腦、心外膜、腸係膜的口腔、食道、直腸等相對比的結構特徵。並認為鈣索動物衹有樁首綱（Stylophora）一個綱，其下分為較原始的角首目 (Cornuta)和從角首類演化出的帽首目(Mitrata)。而頭索動物的祖先可與帽首目中發現於捷剋波希米亞中奧陶統的長頸袋首La□ynocystis有關，尾索動物的祖先可與帽首目中同樣産於波希米亞中奧陶統的槲袋首Balanocystites有關；而脊椎動物的祖先可能與發現於波希米亞和法國的中上奧陶統以及德國下泥盆統的帽袋首 Mitracystites的祖先類型有關。但這一意見仍未被所有的生物學家和古生物學家所接受。
脊椎動物亞門的差不多每一個目都有衆多的化石種類，還有一些絶滅的目和綱。古脊椎動物學專門研究脊椎動物亞門化石及有關脊椎動物起源、進化、不同地質歷史時期的地理分佈等有關問題，成為古生物學中的一個重要分支。
（高林） |
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| 是動物界最高等的一門。共同特徵是：具有脊索；具有背神經管；具有咽鰓裂等。已知約7萬多種，現生的種類有4萬多種，分3個亞門：尾索動物亞門Urochorda如異體住囊蟲Oikopleura dioica、柄海鞘Styela clava；頭索動物亞門Cephalochordata如文昌魚Branchiostoma belcheri；脊椎動物亞門Vertebrata，為此門最重要和最多的類群，包括圓口綱Cyclostomata、軟骨魚綱Chondrichthyes、硬骨魚綱Osteichthyes、兩棲綱Amphibia、爬行綱Reptilia、鳥綱Aves和哺乳綱Mammalia。 |
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- lat.: chordata
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